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LABORATOIRE DE SPECTROMÉTRIE DE MASSE PROTÉOMIQUE LSMP Curie

Protéomique

IBISA

 

Le LSMP fournit aux chercheurs des services/outils pour leur permettre d'analyser les protéines (identification de protéines, comparaison de protéomes / secrétome, analyse de modifications post-traductionnelles, identification de partenaires interagissant avec la protéine d'intérêt, quantification relative …) par spectrométrie de masse. L'objectif est de fournir à nos collaborateurs des hypothèses scientifiques plus rapidement, afin de pouvoir valider fonctionnellement les candidats identifiés/quantifiés.

Types d'analyses :

  • Définition et conception du dessin expérimental
  • Conseils concernant la mise en place du projet
  • Conseils et aide à la préparation de l'échantillon / contrôle qualité
  • Identification des protéines et peptides
  • Comparaison de protéomes
  • Mesure de masse à haute résolution
  • Analyse des modifications post-traductionnelles (localisation et caractérisation)
  • Protéomique ciblée
  • Protéomique quantitative (SILAC, DIA, Label free…)
  • Traitement des données
  • Analyse bioinformatique et statistique

Équipement :

  • Thermo ScientificTM Q ExactiveTM HF-X Hybrid Quadrupole-OrbitrapTM MS
  • Thermo ScientificTM Orbitrap FusionTM TribridTM MS
  • Thermo ScientificTM UltimateTM 3000 RSLCnano LC system
  • Thermo ScientificTM DionexTM UltimateTM 3000 AFC Automated Fraction collector
  • AB SCIEXTM 4800 Plus MALDI TOF/TOFTM MS (2008, Applied Biosystems™)
  • Dionex/LC-Packings ProbotTM Micro Fraction Collector
  • Agilent 3100 OFFGEL Fractionator
  • Bio-Rad PROTEAN® IEF Cell
  • myProMS web server
  • Thermo ScientificTM Proteome DiscovererTM 2.0 software
  • Thermo ScientificTM PinpointTM 1.4 software
  • Database search algorithms (SEQUEST HT, Matrix Science Mascot Server and Daemon 2.5, …)
  • Trans-Proteomic Pipeline (TPP 4.8, ) tools

> En savoir plus : consulter le site web de la plateforme

Localisation

Institut Curie

11-15, rue Pierre et Marie Curie
75005 Paris



Responsables :

  • Damarys LOEW

Existence d'une charte : oui

Modalité d'accès : Plateforme ouverte aux académiques et industriels

Contacter la plateforme


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