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Plateforme Bioinformatique de l'Institut Curie

bioinformatique

COFRAC pour certaines activités

 

La plate-forme de bioinformatique de l'Institut Curie est composée de trente bioinformaticiens, de statisticiens et d'ingénieurs informatiques qui proposent une expertise multidisciplinaire pour soutenir les plates-formes biotechnologiques, les unités de recherche et l'hôpital dans leurs activités quotidiennes. Nos compétences vont de l'analyse statistique de données, la gestion de données, le développement de logiciels et le calcul à haute performance.

Nous avons cinq missions principales :

  • l'intégration de données et de connaissance,
  • le support en bioinformatique et en analyse de données pour les projets collaboratifs avec les biologistes et cliniciens,
  • le conseil et la formation en biostatistique et la bioinformatique,
  • le support pour le calcul à haute performance,
  • la coordination des activités de bioinformatique au sein de l'Institut Curie.

Types d'analyses :

  • analyse statistique de données cliniques et biologiques obtenues à partir de technologies à haut-débit telles que le séquençage, la spectrométrie de masse, les puces protéiques, le phénotypage cellulaire ou les microarrays
  • NGS: WGS, exome, targeted-seq, RNAseq, sRNAseq, lncRNA, ChIPseq, Bisulfite-seq, ATACseq, HiC, *C ...
  • proteomics: MS, phosphoMS, RPPA
  • microarrays: SNP, copy number, expression ...
  • statistics: experiment design, all classical statistical analyses
  • functional analysis using reference bioinformatics databases and tools
  • ...

Équipement :

  • système de stockage de 2 PB
  • cluster de calcul avec 2000 coeurs

> En savoir plus : consulter le site web de la plateforme

Localisation

Institut Curie, Inserm

26 rue d'Ulm
75005 Paris



Responsables :

  • Emmanuel BARILLOT
  • Philippe HUPE

Existence d'une charte : oui

Modalité d'accès : Plateforme ouverte aux académiques et industriels

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