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Plateforme eBio de l'Université Paris-Sud

Analyses NGS

 

La plateforme Bioinformatique eBio créée en décembre 2009, est au centre du dispositif de bioinformatique de l'Université Paris-Sud. Elle est membre de l'Alliance des Plateformes Bioinformatiques d'Ile de France (APLIBIO).

Les missions d'eBio comprennent : (1) le soutien bioinformatique aux projets de recherche, (2) la mise à disposition de moyens de calcul et stockage, (3) le développement et la maintenance de serveurs web de bioinformatique et bases de données de génomique (4) les conseils et formations aux utilisateurs

Types d'analyses :

  • Analyses NGS : ChIP-seq, RIP-Seq, lncRNA, siRNA, miRNA et RNAseq
  • Impact des mutations sur le génome non codant
  • Structure ARN
  • Analyses fonctionnelles par profilage phylogénique

Équipement :

  • Cluster de calcul haute performance avec des noeuds hétérogènes (220 CPU, 1 noeud avec 760 Go RAM et 64 CPU)
  • Serveur Galaxy

> En savoir plus : consulter le site web de la plateforme

Localisation

Université Paris Sud

Institut de Biologie Intégrative de la Cellule I2BC
Bâtiment 400, Université Paris-Sud
Rue G Mendel
91405 Orsay Cedex



Responsables :

  • Daniel GAUTHERET
  • Claire TOFFANO-NIOCHE

Existence d'une charte : non

Modalité d'accès : Plateforme ouverte aux académiques

Demande de compte auprès de la plate-forme, nécessité d'appartenir à une unité mixte avec l'Université Paris-Sud.

Contacter la plateforme


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