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Plateforme Protéomique Structurale et Fonctionnelle, Institut Jacques Monod, PPSF@IJM

Protéomique, spectrométrie de masse

IBISA

 

Le Cancéropôle Île-de-France soutient la Plateforme.

Retrouvez la Charte établie entre le Cancéropôle et la Plateforme ici.

 

La mission de la plateforme Protéomique structurale et fonctionnelle/Spectrométrie de masse est d'offrir à la communauté des chercheurs en biologie des compétences et services permettant d'intégrer des approches protéomiques dans le développement de leurs projets scientifiques.
La plateforme protéomique de l'Institut Jacques Monod a bénéficié depuis 2013 de soutiens financiers importants de la Région Île-de-France (SESAME 2013), de l'ITMO Cancer Avisean, de l'Université Paris Diderot (Actions de Recherche Structurantes) du CNRS et de l'Institut Jacques Monod permettant l'achat d'une instrumentation moderne et performante pour les analyses protéomiques.

Types d'analyses :

  • Shotgun Proteomic analysis
  • Identification : complex samples (crude cell extracts) ; IP and co-IP ; Purified proteins (QC)
  • Post-translational modifications : Phosphoproteome ; Ubiquitome/Sumoylome ; Methylation/ Acetylation ; Glycosylation ; Glycans ; Glycopeptides
  • Quantification
  • SILAC, pulsed SILAC, iTRAQ, TMT, label free, SLIM-labeling
  • Targeted quantification : PRM
  • Glycans quantification
  • Top-down Protein analysis : infusion or in LC-MSMS mode
  • Sample preparation

Équipement :

  • Easy NLC 1200 (x1), 1000 (x2)
  • RSLC Dionex U3000
  • Dionex U3000
  • Easy Spray sources, Thermo (x3)
  • ESI standard, Thermo
  • Source NanoMate, Advion
  • MALDI TOF/TOF 4800 Plus, AB Sciex
  • Orbitrap Q-Exactive Plus, Thermo (x2)
  • Orbitrap Fusion Tribrid ETD, Thermo
  • 8-channels pipeter Starlet, Hamilton
  • Spot-picker, Biorad
  • Cluster de calcul, serveurs (Alineos)
  • NAS 2x 96 To (Alineos)
  • Moteur de recherche: Mascot server, Peaks server, Bionyc, Proteome Discoverer, Sequest, Pinnacle, Progenesis
  • GelFree system (Expedeon)

> En savoir plus : consulter le site web de la plateforme

Localisation

Université Paris Diderot, CNRS

Institut Jacques-Monod, Bâtiment Buffon
Aile B, 6e étage
15 rue Hélène Brion
75205 Paris Cedex 13



Responsables :

  • Jean-Michel CAMADRO
  • Thibaut LEGER
  • Camille GARCIA

Existence d'une charte : oui

Modalité d'accès : Plateforme ouverte aux académiques et industriels

En plus d'être ouverte aux chercheurs de l'Institut Jacques-Monod, du CNRS et de l'Université Paris Diderot, la plateforme Protéomique structurale et fonctionnelle/Spectrométrie de masse est largement ouverte aux chercheurs d'autres laboratoires publics ou privés.

Pas de réservation. Le principe de fonctionnement est « premier arrivé, premier servi » considérant qu'une série d'acquisition ne doit pas mobiliser la plate-forme Protéomique/Spectrométrie de masse plusieurs journées consécutives pour permettre l'accès de la plate-forme au plus grand nombre d'utilisateurs.

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