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Formation statistiques “Analyse de données biomédicales avec R”

Dans le cadre de ses missions, le Cancéropôle Île-de-France organise une formation en statistique dédiée à l’analyse de données biomédicales avec le logiciel R Studio. Elle est  est ouverte aux chercheurs en recherche fondamentale, translationnelle ou clinique académiques FRANCILIENS impliqués dans un ou plusieurs projets de recherche en cancérologie.

Prochaine session : premier semestre 2018.

Ouverture des inscriptions en janvier / février 2018.

Les frais de formation sont pris en charge par le Cancéropôle IDF.

Objectifs

Maîtriser :

  • les procédures d’aggrégation de données biomédicales,
  • les principales commandes graphiques,
  • les procédures de tests et les modèles statistiques courants.

Les illustrations seront réalisées avec le logiciel RStudio.

Programme

Gestion de sources de données

  • Importation de données tabulaires simples (Excel, CSV, texte) et spécifiques (Stata, SPSS, SAS)
  • Sauvegarde de bases de données R

Organisation d’une base de données R

  • Objets de base : vecteur, matrice, liste
  • Le concept de data frame
  • Codage des variables catégorielles
  • Représentation et manipulation des dates
  • Indexation, sélection et filtrage
  • Réorganisation de base de données (format long/large)

Représentations graphiques

  • Graphiques de base
  • Le package ggplot2

Aggrégation de données et tests de comparaisons

  • Résumé numérique et graphique pour données numériques et catégorielles
  • Comparaison de moyennes et de proportions

Modèle linéaire et applications

  • Analyse de variance à 1 et 2 facteurs
  • Régression linéaire simple et multiple
  • Analyse de covariance
  • Régression logistique

 

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