Groupe de travail NGS & Cancer

Le groupe de travail “NGS & Cancer” a pour objectif la formation des chercheurs dans le domaine du cancer aux techniques d’analyses bio-informatiques. Depuis 2014, il organise des formations pratiques en salle à l’analyse de données NGS pour leur permettre de devenir autonome pour le traitement de leurs données de séquençage, notamment lorsqu’ils ne bénéficient pas du soutien d’une plateforme.

De manière à permettre au plus grand nombre de s’initier aux techniques de traitement massif des données, il a également réalisé une série de vidéos tutorielles permettant la prise en main du logiciel Galaxy, ainsi que d’apprendre à réaliser des traitements complets de données NGS (Next Generation Sequencing) pour des analyses de type DNA-Seq, RNA-Seq ou ChIP-Seq.

 

Les membres de ce groupe de travail sont des bio-informaticiens spécialistes du domaine du cancer, travaillant sur de grandes plateformes franciliennes dédiées  :

  • Yannick Boursin, Gustave Roussy
  • Jean-Charles Cadoret, Institut Jacques Monod – Université Paris Diderot
  • Marc Deloger, Institut Curie
  • M’Boyba Diop, Gustave Roussy
  • Elodie Girard, Institut Curie
  • Nicolas Servant, Institut Curie
  • Laurène Six, Institut Curie
  • Aurélie Teissandier, Institut Curie
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