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NOS ACTIONS D'Accompagnement

Pour accompagner un maximum de chercheurs de son territoire, le Cancéropôle Île-de-France propose aux cliniciens et chercheurs des formations et des outils pratiques ayant pour objectif de les aider à améliorer leurs pratiques.

  • Formations : en format présentiel ou MOOC, elles ont pour objectif d’apporter aux chercheurs franciliens travaillant dans le domaine du cancer de nouvelles compétences ;
  • Outils pratiques : développés par les groupes de travail, ces annuaires, atlas ou diagrammes méthodologiques, ils sont disponibles en libre accès.

Analyse de l’expression différentielle à partir de données RNA-Seq

En complément de nos formations NGS & Cancer dédiées à l’apprentissage d’analyse de données NGS avec R et R Studio, nous vous proposons de vous familiariser avec l’outil d’analyse bio-informatique Galaxy de manière autonome via ces vidéos tutorielles.

Programme
DE LA FORMATION EN LIGNE

  1. Introduction à Galaxy
  2. Analyses DNA-Seq
  3. Analyses RNA-Seq
  4. Analyses épigénomiques
  5. Utilisation des bases de données
  6. Visualisation de données génomiques

Ce cours vous permettra de réaliser l’analyse de l’expression différentielle à partir de données RNA-Seq sous Galaxy. L’objectif est de vous permettre de déterminer si certains gènes sont plus exprimés dans une condition que dans une autre, et ce à partir d’ARN d’un organisme séquencé placé sous deux conditions différentes.

Formateur : Coline Billeret, CNRS, Université Paris Sud.

Durée : 21:45

À télécharger pour l’exercice :

  • Données test : .zip, 247,7 Mo

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