NOS ACTIONS D'Accompagnement

Pour accompagner un maximum de chercheurs de son territoire, le Cancéropôle Île-de-France propose aux cliniciens et chercheurs des formations et des outils pratiques ayant pour objectif de les aider à améliorer leurs pratiques.

  • Formations : en format présentiel ou MOOC, elles ont pour objectif d’apporter aux chercheurs franciliens travaillant dans le domaine du cancer de nouvelles compétences ;
  • Outils pratiques : développés par les groupes de travail, ces annuaires, atlas ou diagrammes méthodologiques, ils sont disponibles en libre accès.

TCGA / ICGC : analyser des données génomiques du cancer

En complément de nos formations NGS & Cancer dédiées à l’apprentissage d’analyse de données NGS avec R et R Studio, nous vous proposons de vous familiariser avec l’outil d’analyse bio-informatique Galaxy de manière autonome via ces vidéos tutorielles.

Programme
DE LA FORMATION EN LIGNE

Les outils TCGA et de ICGC permettent d’analyser des données de génomique mises à disposition de la communauté scientifique.

Ce cours vous apprendra à utiliser les deux outils pour créer une carte et un catalogue des anomalies génétiques des différentes tumeurs:

  • Présentation de TCGA et de ICGC
  • Visualisation des projets
  • Exploration et analyse des données
  • Accès aux données restreintes

Formateur : Yannick Boursin, Institut Gustave Roussy

Durée : 58:29

Accéder à TCGA : https://cancergenome.nih.gov/ et https://portal.gdc.cancer.gov/

Accéder à ICGC : https://icgc.org/ et https://dcc.icgc.org/