LABORATOIRE DE SPECTROMÉTRIE DE MASSE PROTÉOMIQUE LSMP Curie
Protéomique
IBISA
Le LSMP fournit aux chercheurs des services/outils pour leur permettre d'analyser les protéines (identification de protéines, comparaison de protéomes / secrétome, analyse de modifications post-traductionnelles, identification de partenaires interagissant avec la protéine d'intérêt, quantification relative …) par spectrométrie de masse. L'objectif est de fournir à nos collaborateurs des hypothèses scientifiques plus rapidement, afin de pouvoir valider fonctionnellement les candidats identifiés/quantifiés.
Types d'analyses :
- Définition et conception du dessin expérimental
- Conseils concernant la mise en place du projet
- Conseils et aide à la préparation de l'échantillon / contrôle qualité
- Identification des protéines et peptides
- Comparaison de protéomes
- Mesure de masse à haute résolution
- Analyse des modifications post-traductionnelles (localisation et caractérisation)
- Protéomique ciblée
- Protéomique quantitative (SILAC, DIA, Label free…)
- Traitement des données
- Analyse bioinformatique et statistique
Équipement :
- Thermo ScientificTM Q ExactiveTM HF-X Hybrid Quadrupole-OrbitrapTM MS
- Thermo ScientificTM Orbitrap FusionTM TribridTM MS
- Thermo ScientificTM UltimateTM 3000 RSLCnano LC system
- Thermo ScientificTM DionexTM UltimateTM 3000 AFC Automated Fraction collector
- AB SCIEXTM 4800 Plus MALDI TOF/TOFTM MS (2008, Applied Biosystems™)
- Dionex/LC-Packings ProbotTM Micro Fraction Collector
- Agilent 3100 OFFGEL Fractionator
- Bio-Rad PROTEAN® IEF Cell
- myProMS web server
- Thermo ScientificTM Proteome DiscovererTM 2.0 software
- Thermo ScientificTM PinpointTM 1.4 software
- Database search algorithms (SEQUEST HT, Matrix Science Mascot Server and Daemon 2.5, …)
- Trans-Proteomic Pipeline (TPP 4.8, ) tools
Localisation
Institut Curie
11-15, rue Pierre et Marie Curie
75005 Paris
Responsables :
- Damarys LOEW
Existence d'une charte : oui
Modalité d'accès :
Plateforme ouverte aux académiques et industriels inconnues