Analyse de l’expression différentielle à partir de données RNA-Seq

Ce cours vous permettra de réaliser l’analyse de l’expression différentielle à partir de données RNA-Seq sous Galaxy. L’objectif est de vous permettre de déterminer si certains gènes sont plus exprimés dans une condition que dans une autre, et ce à partir d’ARN d’un organisme séquencé placé sous deux conditions différentes.

Formateur : Coline Billeret, CNRS, Université Paris Sud.

Durée : 21:45

À télécharger pour l’exercice :

  • Données test : .zip, 247,7 Mo

 

 

Voir aussi…
Introduction à Galaxy Utilisation des bases de données 
TCGA / ICGC
cBioPortal
– ENCODE (à venir)
Visualisation de données génomiques
avec IGV
avec UCSC
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