cBioPortal : explorer, visualiser et analyser des données génomiques du cancer

Ce cours vous permettra de découvrir et apprendre à utiliser l’outil en ligne cBioPortal, qui permet d’explorer, visualiser et analyser des données de génomiques de type ADN, ARN, protéines, qui proviennent de multiples études dont les données ont été mis à disposition de la communauté scientifique.

Le cours aborde les sujets suivants :

  • Présentation de la base de données cBioPortal
  • Exploration des données cliniques
  • Exploration par gène d’intérêt
  • Introduction à l’utilisation des outils avancés : utilisation des données de la base cBioPortal via R Studio ou utilisation des outils cBioPortal pour explorer ses propres données

 

Formateur : Marc Deloger, Institut Curie.

Durée : 34:04

Accéder à cBioPortal : http://www.cbioportal.org

 

Voir aussi…
Introduction à Galaxy Utilisation des bases de données 
TCGA / ICGC
cBioPortal
– ENCODE (à venir)
Visualisation de données génomiques
avec IGV
avec UCSC
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