TCGA / ICGC : analyser des données génomiques du cancer
Les outils TCGA et de ICGC permettent d’analyser des données de génomique mises à disposition de la communauté scientifique.
Ce cours vous apprendra à utiliser les deux outils pour créer une carte et un catalogue des anomalies génétiques des différentes tumeurs:
- Présentation de TCGA et de ICGC
- Visualisation des projets
- Exploration et analyse des données
- Accès aux données restreintes
Formateur : Yannick Boursin, Institut Gustave Roussy
Durée : 58:29
Accéder à TCGA : https://cancergenome.nih.gov/ et https://portal.gdc.cancer.gov/
Accéder à ICGC : https://icgc.org/ et https://dcc.icgc.org/
Voir aussi… | ||
Introduction à Galaxy | Analyse de données – Analyses DNA-Seq – Analyses RNA-Seq – Analyses ChIP-Seq |
Utilisation des bases de données – TCGA / ICGC – cBioPortal – ENCODE (à venir) |