Groupe de travail NGS & Cancer
Le groupe de travail “NGS & Cancer” a pour objectif la formation des chercheurs dans le domaine du cancer aux techniques d’analyses bio-informatiques. Depuis 2014, il organise des formations pratiques en salle à l’analyse de données NGS pour leur permettre de devenir autonome pour le traitement de leurs données de séquençage, notamment lorsqu’ils ne bénéficient pas du soutien d’une plateforme.
De manière à permettre au plus grand nombre de s’initier aux techniques de traitement massif des données, il a également réalisé une série de vidéos tutorielles permettant la prise en main du logiciel Galaxy, ainsi que d’apprendre à réaliser des traitements complets de données NGS (Next Generation Sequencing) pour des analyses de type DNA-Seq, RNA-Seq ou ChIP-Seq.
Les membres de ce groupe de travail sont des bio-informaticiens spécialistes du domaine du cancer, travaillant sur de grandes plateformes franciliennes dédiées :
- Yannick Boursin, Gustave Roussy
- Jean-Charles Cadoret, Institut Jacques Monod – Université Paris Diderot
- Marc Deloger, Institut Curie
- M’Boyba Diop, Gustave Roussy
- Elodie Girard, Institut Curie
- Nicolas Servant, Institut Curie
- Laurène Six, Institut Curie
- Aurélie Teissandier, Institut Curie