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Annuaire plateformes

Le Cancéropôle Île-de-France a organisé, via son groupe de travail “Plateformes”, un recensement des plateformes technologiques franciliennes œuvrant dans le domaine de la recherche sur le cancer. Les plateformes identifiées ont été regroupées au sein d’un annuaire mis à disposition de la communauté francilienne.

 

Vous êtes responsable d’une plateforme technologique francilienne et êtes impliqué dans la recherche sur le cancer ? Vous souhaitez figurer dans cet annuaire ?
Nous vous remercions de renseigner le formulaire dédié.

Pour toute question, n’hésitez pas à nous contacter à l’adresse communication@canceropole-idf.fr.

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61 résultats

Thématique : Radiothérapie

Certification : aucune

Types d'analyses : Irradiation ; Dosimétrie ; Étalonnage de détecteurs

Thématique : Génomique et transcriptomique

Certification : aucune

Types d'analyses : Conseil en génomique ; Préparation d'échantillon (cryo-section, microdissection laser, purification d'acides nucleiques) ; Analyse Génomique (genome wide par analyse en micorarray, analyse de mutations ponctuelles, de polymorphismes) ; Analyse Transcriptomique: de genome entier, or analyse ciblée (Nanostring), test de signature transcriptomique ; Analyse de la régulation de l'expression des gènes: miRNA, ncRNA, analyse de la méthylation (OxBS), analyse de la conformation de la chromatine

Thématique : Génomique

Certification : ISO9001, NFX 50900

Types d'analyses : Puces ADN (Illumina, Génotypage et Transcriptome) ; NGS

Thématique : Génomique

Certification : ISO9001

Types d'analyses : qPCR au format 1536 puits ; Séquençage moyen débit ; NGS (exomes, Custom Capture, target amplicon, RNAseq, MethylSeq,...) ; Génotypage ; Purification et analyse des produits de PCR

Thématique : Génomique, Next Generation Sequencing

Certification : Membre du réseau France Génomique

Types d'analyses : Génomique : WGS, WES, targeted sequencing ; Transcriptomique : RNAseq, small RNAseq, single cell RNAseq ; Epigénétique : ChIPseq, ATACseq, WGBS, HiC, ...

Thématique : Génomique

Certification : aucune

Types d'analyses : Séquençage haut débit NGS (Whole Genome, Exome, RNA-seq, ChIP-seq, target resequencing) ; Technologies d'hybridation sur puces

Thématique : Génomique

Certification : ISO 9001

Types d'analyses : qPCR à haut débit : CNV, SNP, génotypage, PCR digitale ; Préparation de banques pour séquençage (système Acces Array) ; Analyses Bio-statistiques

Thématique : Génomique fonctionnelle

Certification : ISO 9001 (mars 2013), NF X50-900 (avril 2015)

Types d'analyses : Séquençage à haut débit en génomique fonctionnelle (RNA-Seq, ChIP-Seq)

Thématique : Métabolomique

Certification : aucune

Types d'analyses : Profilage non-biaisé d'échantillons biologiques par UHPLC/q-Exactive ; Analyse semi-quantitative de larges gammes de molécules endogènes ; Elucidation structurale par MS Haute Résolution ; Recherche de produits de métabolisation de médicaments par MS Haute Résolution ; Analyse quantitative de métabolites candidats ; Assister les scientifiques tout au long du projet métabolomique, incluant les étapes pré- et post-analytiques ; Aider à définir les questions découlant du projet et le design expérimental y répondant ; Mise en place de protocoles d'extraction adaptés à la nature des échantillons ; Intégration des données métabolomiques pour l'analyse statistique ; Aide à l'interprétation biologique, dans le contexte expérimental

Thématique : Métabolomique

Certification : IBISA

Types d'analyses : LC/HRMS, MALDI-TOF/TOF

Thématique : Métabolomique

Certification : aucune

Types d'analyses : Mass Spectrometry

Thématique : Protéomique

Certification : aucune

Types d'analyses : couplage LC-MS

Thématique : Protéomique

Certification : aucune

Types d'analyses : nanoHPLC ; Mass Spectrometry ; Liquid Protein Fractionation

Thématique : Protéomique

Certification : IBISA

Types d'analyses : Définition et conception du dessin expérimental ; Conseils concernant la mise en place du projet ; Conseils et aide à la préparation de l'échantillon / contrôle qualité ; Identification des protéines et peptides ; Comparaison de protéomes ; Mesure de masse à haute résolution ; Analyse des modifications post-traductionnelles (localisation et caractérisation) ; Protéomique ciblée ; Protéomique quantitative (SILAC, DIA, Label free…) ; Traitement des données ; Analyse bioinformatique et statistique

Thématique : Protéomique

Certification : aucune

Types d'analyses : LC-MS/MS ; MALDI-TOF/TOF ; MALDI-TOF ; 2D-DIGE ; 2D gels and/or LC-MS/MS ; MALDI-TOF

Thématique : Protéomique

Certification : aucune

Types d'analyses : Mass Spectrometry (MS) ; nanoLC-MS-MS Tandem Mass spectrometry ; Tandem Mass spectrometry (MS-MS)

Thématique : Protéomique

Certification : aucune

Types d'analyses : LC-MS/MS

Thématique : Protéomique

Certification : Global RPPA Society

Types d'analyses : Conseils sur votre design expérimental, participation à l'écriture de votre demande de financement (le cas échéant). ; Validation de nouveaux anticorps primaires ; Prise en charge des échantillons (lyse protéique, dosage par kit BCA) ; Création des puces (préparation des plaques 384 puits, dépôt sur puce en plusieurs dilutions et plusieurs réplicats par échantillon) ; Révélation des puces avec les anticorps primaires de votre choix ; Lecture des puces, quantification du signal ; Un contrôle qualité semi-automatisé des données ; Normalisation des données ; Analyses exploratoires (ACP et clustering hiérarchique) et analyses différentielles selon vos questions biologiques ; Assistance lors de l'écriture de votre publication ; Stockage sécurisé des échantillons et des données pendant au moins 3 ans

Thématique : Protéomique

Certification : aucune

Types d'analyses : Biochimie des protéines SDS-PAGE ; Spectrométrie de masse ; Séparation HPLC (nano / micro) ; Techniques de purification

Thématique : Protéomique

Certification : aucune

Types d'analyses : Electrophoresis 1D/2D ; Liquid chromatography ; Mass spectrometry

Thématique : Protéomique

Certification : ISO 9001, IBISA

Types d'analyses : Identification et caractérisation de protéines dans des fragments de gels ou en solution : recherche de partenaires protéiques ; Analyse de fractions sub-cellulaires dont sécrétomes et microvésicules ; Analyse des modifications post-traductionnelles globales ou ciblées : phosphorylations, méthylations, acétylations ; Analyses quantitatives globales par méthode "LabelFree" ou par marquage (SILAC, ITRAQ, TMT) ; Analyses quantitatives ciblées MRM, PRM ; Immunoanalyse ciblée d'expression protéique ou de modifications post-traductionnelles entraînant des modifications de pI

Thématique : Protéomique, spectrométrie de masse

Certification : IBISA

Types d'analyses : Shotgun Proteomic analysis ; Identification : complex samples (crude cell extracts) ; IP and co-IP ; Purified proteins (QC) ; Post-translational modifications : Phosphoproteome ; Ubiquitome/Sumoylome ; Methylation/ Acetylation ; Glycosylation ; Glycans ; Glycopeptides ; Quantification ; SILAC, pulsed SILAC, iTRAQ, TMT, label free, SLIM-labeling ; Targeted quantification : PRM ; Glycans quantification ; Top-down Protein analysis : infusion or in LC-MSMS mode ; Sample preparation

Thématique : Génomique

Certification : aucune

Types d'analyses : QPCR haut débit ; NGS

Thématique : Génomique et transcriptomique

Certification : ISO 9001 V2

Types d'analyses : puces à ADN (transcriptome principalement) : production de données et analyse suivant prestations de service / 1700 échantillons en 2016 / 80 projets traités / 12 publications ; Analyses ciblées par PCR temps réel et technologie Nanostring : production de données et analyse sous forme de prestations, formation des utilisateurs ; NGS (séquençage ciblé, exome, RNAseq, ..) : production de données et analyse suivant prestations de service et sous forme de gestion de projets / 900 échantillons en 2016 / 30 projets traités ; contrôle qualité des ARN sous forme de prestations de service

Thématique : Génomique

Certification : aucune

Types d'analyses : NGS ILLUMINA ; Puces AFFYMETRIX ; PCR Dig Raindance ; PCR microfluidique Fluidigm ; Qualification Acides Nucleiques

Thématique : Imagerie cellulaire

Certification : aucune

Types d'analyses : histologie : Histologie, analyseur d'image, numérisation

Thématique : Imagerie cellulaire

Certification : aucune

Types d'analyses : Imagerie photonique ; Microscopie : HCA, Confocal, Champ Large, MET ; Séquençage haut débit ciblé

Thématique : Imagerie cellulaire

Certification : aucune

Types d'analyses : Microscopie photonique : champ large, confocal , microscopie résolue en temps, super resolution

Thématique : Imagerie in vivo

Certification : aucune

Types d'analyses : cytométrie et microscopie photonique : Cytométrie haut débit (16 couleurs); Tri Cellulaire (14 couleurs); Cyto imageur (Mark II) ; Microscopie confocale et haut débit

Thématique : Imagerie cellulaire

Certification : Réseau France Life Imaging, réseau NeurATRIS

Types d'analyses : Infrastructure informatique, logiciels dédiés : Collaboration avec les équipes du CATI, traitement des données acquises sur les systèmes d'imagerie, imagerie et génétique,

Thématique : Imagerie cellulaire

Certification : Réseau France Life Imaging, réseau NeurATRIS

Types d'analyses : Micro-endoscopie, imagerie par fluorescence planaire et 3D : Cellvizio (Maunakea) Tomofluo3D (CEA/Leti)

Thématique : Imagerie in vivo

Certification : Réseau FRISBI

Types d'analyses : microscopie confocale, multiphoton et résolue en temps, interactions protéine-protéine, photoactiavation in cellulo :

Thématique : Imagerie cellulaire

Certification : aucune

Types d'analyses : microscopie photonique : Microscopie confocale

Thématique : Maladies infectieuses

Certification : ISO 9001 V2015, IBISA

Types d'analyses : Immuno-monitorage moléculaire sur échantillons précliniques ou cliniques ; Virologie/biologie moléculaire (PCR, Q-PCR, RT-PCR) sur échantillons précliniques ou cliniques ; Etudes de pharmaco-cinétiques et de pharmaco-distributions chez les primates non Humains ; Essais vaccinaux chez les primates non Humains ; Essais thérapeutiques (anticorps, peptides, composés chimiques, nano-objects...) chez les primates non Humains ; Etudes d'immunogénicité chez les primates non Humains ; Etudes des réponses cellulaires su système immunitaire chez les primates non Humains : Cytométrie en flux ; Tri-cellulaire ; Cytométrie de masse ; Bio-informatique : stockage, analyse, modélisation des données expérimentales ; Imagerie in vivo chez les primates non Humains : fluorescence dans le proche infra-rouge ; endos-microscopie convocable ; microscopie bi-photon in vivo ; TEP-CT sur corps entiers primates non humains vivants ; RMN 7 et 11.4 Teslas (collaboration avec le département MIRCen sur le même site CEA/FAR) ; Développement de modèles animaux précliniques (primates non-humains) de différentes pathologies infectieuses

Thématique : Imagerie cellulaire

Certification : aucune

Types d'analyses : biologie moléculaire : clonage, hybridation in situ, biologie moléculaire, transcription in vitro

Thématique : Imagerie cellulaire

Certification : IBISA

Types d'analyses : criblage RNAi :

Thématique : Exploration fonctionnelle

Certification : Label Medicen, ISO 9001:2008

Types d'analyses : Elevage ; Exploration fonctionnelle ; Comité d'éthique

Thématique : Imagerie cellulaire

Certification : aucune

Types d'analyses : microscopie électronique à transmission : Microscopie électronique - Imagerie - Tomographie - Ultramicrotomie - Ultrastructure - Biologie Cellulaire

Thématique : Imagerie cellulaire

Certification : aucune

Types d'analyses : microscopie confocale ; multiphoton ; spinning disc et macroscopie ; photo-manipulation ; TIRF ; Haute resolution : CLSM/ très haute résolution spatiale ; Imagerie in vivo ; Développpement de protocoles de clarification de tissu ; Deconvolution ; Analyse spatiale en 3D ; Etude de colocalisation

Thématique : Imagerie

Certification : IBiSA 2015, INBS du PIA FranceBioImaging, Réseau EuroBioIMaging

Types d'analyses : imageries photonique, electronique, ionique, HCS : Data Management and data Base/ CLSM/ haute résolution spatio-temporelle, dSTORM, PALM, 3D TIRFM.../Feuille de lumière: SPIM et LLSM /optogénétique/ imagerie in vivo etudes longitudinales SHG,THG)/TEM, CryoTomoEM/NanoSIMS, Imagerie et analyse Haut Débit/

Thématique : Immuno/microenvironnement tumoral

Certification : aucune

Types d'analyses : IHC-numerisation-analyse d'image

Thématique : Immunomonitoring Micro-environnement

Certification : aucune

Types d'analyses : Cytométrie, reconnaissance d'image, deep sequencing

Thématique : Cytométrie en flux

Certification : ISO 9001 version 2008

Types d'analyses : mise à disposition d'équipements (cytomètres analyseurs multi-couleurs,...) ; prestations de tri cellulaire ; prestations de multi-dosages (Luminex, MSD, Quanterix) ; prise en charge de projets d'immunobiologie (phénotypages multiparamétriques, culture cellulaire, tests de prolifération, Elispot...)

Thématique : Immuno-Oncologie

Certification : aucune

Types d'analyses : multiparameter cytometry; Dry formulation of cocktail antibodies

Thématique : Immuno/microenvironnement tumoral

Certification : aucune

Types d'analyses : predictive T cell assays, HLA binding, in silico prediction

Thématique : Physiologie/Physiopathologie et Cancer/immunologie/Immunopathologie

Certification : aucune

Types d'analyses : TME

Thématique : Physiologie/Physiopathologie et Cancer/immunologie/Immunopathologie

Certification : aucune

Types d'analyses : Cytométrie en Flux, TME ; Imagerie Cell, TME

Thématique : Imagerie

Certification : ISO 9001 v2015

Types d'analyses : Imagerie photonique ; HCS ; Imagerie haute résolution spatio-temporelle ; STORM ; PALM ; 3D TIRFM ; SIM ; optogénétique ; imagerie in vivo ; etudes longitudinales SHG, THG ; Imagerie et analyse Haut Débit ; imagerie luminescence ; FMT ; CLEM

Thématique : Imagerie cellulaire

Certification : IBiSA|ISO9001

Types d'analyses : Macroscopie colorant fluorescence ; Microscopie plein champ colorant fluorescence ; Microscopie confocale spinning disk L1 L2 L3 ; Microscopie multi-photonique SHG ; Imagerie en Flux ; Microscopie de super-résolution PALM STORM 3D multi-couleur ; TIRF FRET FRAP Photo-activation Photo-convertion ; Photo-dommage ; Prestations : coupe épaisse, clarification, chirurgie ; Traitement d'image ; Image Database ; Restauration d'image par déconvolution 3D en ligne

Thématique : Imagerie cellulaire

Certification : IBiSA ISO 9001:2008 - NFX 50:900, membre du PIA FranceBioImaging, Réseau EuroBioIMaging

Types d'analyses : microscopie confocale ; super-résolution PALM ; dSTORM ; SIM ; interactions moleculaires (FRET, FRAP, FLIM,FCS) ; Feuille de lumière ; imagerie in vivo ; microscopie non-lineaire multimodale (multiphoton, SHG,THG) ; Microscopie électronique à transmission ; Microscopie électronique à balayage ; Serial-Block face SEM ; Ultramicrotomie ; cryo-ultramicrotomie ; Ultrastructure ; Cytométrie en flux ; Imagerie en flux ; Tri cellulaire

Thématique : Microscopie électronique

Certification : aucune

Types d'analyses : Préparation d'échantillons en MET et en MEB ; Formations à la préparation d'échantillons et à l'observation ; Séances d'observation autonome ; Séance d'observation assistée d'un ingénieur ; Projet collaboratif à long terme

Thématique : Imagerie photonique cellulaire, tissulaire et in vivo

Certification : Label Medicen

Types d'analyses : Imagerie photonique du modèle murin au patient : Imagerie cellulaire / tissulaire, confocale et multiphotonique ; Imagerie transmodalités: organes vivants , petits animaux et imagerie photonique clinique (NIR et confocale) ; Cytométrie en flux et de masse quantitative et tri cellulaire à haut débit ; Développements innovants : nouveaux dispositifs optiques / transfert clinique de l'imagerie photonique / approche multidisciplinaire pour l'imagerie fonctionnelle à haute résolution au niveau moléculaire, cellulaire et tissulaire ; Traitement des données et quantification

Thématique : Analyses NGS

Certification : aucune

Types d'analyses : Analyses NGS : ChIP-seq, RIP-Seq, lncRNA, siRNA, miRNA et RNAseq ; Impact des mutations sur le génome non codant ; Structure ARN ; Analyses fonctionnelles par profilage phylogénique

Thématique : Génomique

Certification : aucune

Types d'analyses : Extractions d'acides nucléiques ; Qualifications (Bioanalyzer 2100, Tapestation 2200)

Thématique : bioinformatique

Certification : COFRAC pour certaines activités

Types d'analyses : analyse statistique de données cliniques et biologiques obtenues à partir de technologies à haut-débit telles que le séquençage, la spectrométrie de masse, les puces protéiques, le phénotypage cellulaire ou les microarrays ; NGS: WGS, exome, targeted-seq, RNAseq, sRNAseq, lncRNA, ChIPseq, Bisulfite-seq, ATACseq, HiC, *C ... ; proteomics: MS, phosphoMS, RPPA ; microarrays: SNP, copy number, expression ... ; statistics: experiment design, all classical statistical analyses ; functional analysis using reference bioinformatics databases and tools ; ...

Thématique : bioinformatique

Certification : aucune

Types d'analyses :

Thématique : Immuno/microenvironnement tumoral

Certification : aucune

Types d'analyses : cytométrie en flux, analyses fonctionnelles (production de cytokines, fonctions NK), dosages sériques de ligands solubles NKG2D (MICA, ULBP2)

Thématique : Hémato- Immuno- cytométrie fonctionnelle

Certification : aucune

Types d'analyses : Phénotypages cellulaires multicouleurs ; Signalisation cellulaire ; Cycles cellulaires ; Etude de l'apoptose, seule ou simultanément avec la chute du potentiel membranaire de la mitochondrie et la mortalité cellulaire ; L'analyse fonctionnelle de la surexpression ou de l'extinction de gènes (shRNA) ; L'étude de la prolifération cellulaire ; L'analyse et le tri des cellules souches ; L'étude des flux calciques ; …/…

Thématique : Immuno/microenvironnement tumoral

Certification : aucune

Types d'analyses : Auto-immunité

Thématique : Immuno/microenvironnement tumoral

Certification : Elispot accrédité Cofrac

Types d'analyses : Cytomètrie-Elispot-Luminex

Thématique : Immuno/microenvironnement tumoral

Certification : aucune

Types d'analyses : Immunofluorescence in situ

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