Annuaire plateformes

Thématique : Cytométrie, Immunophénotypage, Protéomique, Single Cell, Spatial

Certification : IBISA

Types d'analyses : Analyses phénotypiques de biomarqueurs circulants, vésicules extracellulaires, cellules et tissus ; Approches simplex ou multiplex à la résolution single cell ; Cytométrie conventionnelle, spectrale, en image et spatiale ; Tris cellulaires en bulk, monoclonal ou single cell ; Mise à disposition, assistance ou collaboration ; Formation à l'utilisation des instruments et des logiciels d'analyse ; Accompagnement dans l'élaboration des expériences (protocole, panel design, instrumentation adaptée, analyse, …) ; Organisation de workshops, webinaires, séminaires, tutorials, … ; Travail en synergie avec des plateformes complémentaires (NGS, Bioinformatic, CustomSingleCell, ExtraCellular Vesicles, …)

Thématique : Cytométrie et Imagerie

Certification : aucune

Types d'analyses : Cytométrie de masse ; Imagerie multiparamétrique (37 marqueurs simultanéement) ; Cytométrie spectrale ; Tri cellulaire ; Tri cellulaire infectieux ; Tri cellulaire humain

Thématique : Radiothérapie

Certification : aucune

Types d'analyses : Irradiation ; Dosimétrie ; Étalonnage de détecteurs

Thématique : Génomique et transcriptomique

Certification : aucune

Types d'analyses : Conseil en génomique ; Préparation d'échantillon (cryo-section, microdissection laser, purification d'acides nucleiques) ; Analyse Génomique (genome wide par analyse en micorarray, analyse de mutations ponctuelles, de polymorphismes) ; Analyse Transcriptomique: de genome entier, or analyse ciblée (Nanostring), test de signature transcriptomique ; Analyse de la régulation de l'expression des gènes: miRNA, ncRNA, analyse de la méthylation (OxBS), analyse de la conformation de la chromatine

Thématique : Génomique, Next Generation Sequencing

Certification : Membre du réseau France Génomique

Types d'analyses : Génomique : WGS, WES, targeted sequencing ; Transcriptomique : RNAseq, small RNAseq, single cell RNAseq ; Epigénétique : ChIPseq, ATACseq, WGBS, HiC, ...

Thématique : Génomique

Certification : ISO9001

Types d'analyses : qPCR au format 1536 puits ; Séquençage moyen débit ; NGS (exomes, Custom Capture, target amplicon, RNAseq, MethylSeq,...) ; Génotypage ; Purification et analyse des produits de PCR

Thématique : Génomique

Certification : ISO9001, NFX 50900

Types d'analyses : Puces ADN (Illumina, Génotypage et Transcriptome) ; NGS

Thématique : Génomique fonctionnelle

Certification : ISO 9001 (mars 2013), NF X50-900 (avril 2015)

Types d'analyses : Séquençage à haut débit en génomique fonctionnelle (RNA-Seq, ChIP-Seq)

Thématique : Génomique

Certification : ISO 9001

Types d'analyses : qPCR à haut débit : CNV, SNP, génotypage, PCR digitale ; Préparation de banques pour séquençage (système Acces Array) ; Analyses Bio-statistiques

Thématique : Génomique

Certification : aucune

Types d'analyses : Séquençage haut débit NGS (Whole Genome, Exome, RNA-seq, ChIP-seq, target resequencing) ; Technologies d'hybridation sur puces

Thématique : Génomique et transcriptomique

Certification : ISO 9001 V2

Types d'analyses : puces à ADN (transcriptome principalement) : production de données et analyse suivant prestations de service / 1700 échantillons en 2016 / 80 projets traités / 12 publications ; Analyses ciblées par PCR temps réel et technologie Nanostring : production de données et analyse sous forme de prestations, formation des utilisateurs ; NGS (séquençage ciblé, exome, RNAseq, ..) : production de données et analyse suivant prestations de service et sous forme de gestion de projets / 900 échantillons en 2016 / 30 projets traités ; contrôle qualité des ARN sous forme de prestations de service

Thématique : Génomique

Certification : aucune

Types d'analyses : QPCR haut débit ; NGS

Thématique : Protéomique, spectrométrie de masse

Certification : IBISA

Types d'analyses : Shotgun Proteomic analysis ; Identification : complex samples (crude cell extracts) ; IP and co-IP ; Purified proteins (QC) ; Post-translational modifications : Phosphoproteome ; Ubiquitome/Sumoylome ; Methylation/ Acetylation ; Glycosylation ; Glycans ; Glycopeptides ; Quantification ; SILAC, pulsed SILAC, iTRAQ, TMT, label free, SLIM-labeling ; Targeted quantification : PRM ; Glycans quantification ; Top-down Protein analysis : infusion or in LC-MSMS mode ; Sample preparation

Thématique : Protéomique

Certification : ISO 9001, IBISA

Types d'analyses : Identification et caractérisation de protéines dans des fragments de gels ou en solution : recherche de partenaires protéiques ; Analyse de fractions sub-cellulaires dont sécrétomes et microvésicules ; Analyse des modifications post-traductionnelles globales ou ciblées : phosphorylations, méthylations, acétylations ; Analyses quantitatives globales par méthode "LabelFree" ou par marquage (SILAC, ITRAQ, TMT) ; Analyses quantitatives ciblées MRM, PRM ; Immunoanalyse ciblée d'expression protéique ou de modifications post-traductionnelles entraînant des modifications de pI

Thématique : Protéomique

Certification : aucune

Types d'analyses : Electrophoresis 1D/2D ; Liquid chromatography ; Mass spectrometry

Thématique : Protéomique

Certification : aucune

Types d'analyses : Biochimie des protéines SDS-PAGE ; Spectrométrie de masse ; Séparation HPLC (nano / micro) ; Techniques de purification

Thématique : Protéomique

Certification : Global RPPA Society

Types d'analyses : Conseils sur votre design expérimental, participation à l'écriture de votre demande de financement (le cas échéant). ; Validation de nouveaux anticorps primaires ; Prise en charge des échantillons (lyse protéique, dosage par kit BCA) ; Création des puces (préparation des plaques 384 puits, dépôt sur puce en plusieurs dilutions et plusieurs réplicats par échantillon) ; Révélation des puces avec les anticorps primaires de votre choix ; Lecture des puces, quantification du signal ; Un contrôle qualité semi-automatisé des données ; Normalisation des données ; Analyses exploratoires (ACP et clustering hiérarchique) et analyses différentielles selon vos questions biologiques ; Assistance lors de l'écriture de votre publication ; Stockage sécurisé des échantillons et des données pendant au moins 3 ans

Thématique : Protéomique

Certification : aucune

Types d'analyses : LC-MS/MS

Thématique : Protéomique

Certification : aucune

Types d'analyses : Mass Spectrometry (MS) ; nanoLC-MS-MS Tandem Mass spectrometry ; Tandem Mass spectrometry (MS-MS)

Thématique : Protéomique

Certification : aucune

Types d'analyses : LC-MS/MS ; MALDI-TOF/TOF ; MALDI-TOF ; 2D-DIGE ; 2D gels and/or LC-MS/MS ; MALDI-TOF

Thématique : Protéomique

Certification : IBISA

Types d'analyses : Définition et conception du dessin expérimental ; Conseils concernant la mise en place du projet ; Conseils et aide à la préparation de l'échantillon / contrôle qualité ; Identification des protéines et peptides ; Comparaison de protéomes ; Mesure de masse à haute résolution ; Analyse des modifications post-traductionnelles (localisation et caractérisation) ; Protéomique ciblée ; Protéomique quantitative (SILAC, DIA, Label free…) ; Traitement des données ; Analyse bioinformatique et statistique

Thématique : Protéomique

Certification : IBiSA

Types d'analyses : nanoLC MS/MS ; Proteolysis ; MALDI/ESI MS/MS ; SILAC, label free quantification, TMT ; redoxomic ; glycomics ; whole protein analysis and identification

Thématique : Protéomique

Certification : aucune

Types d'analyses : couplage LC-MS

Thématique : Métabolomique

Certification : aucune

Types d'analyses : Mass Spectrometry

Thématique : Métabolomique

Certification : IBISA

Types d'analyses : LC/HRMS, MALDI-TOF/TOF

Thématique : Métabolomique

Certification : aucune

Types d'analyses : Profilage non-biaisé d'échantillons biologiques par UHPLC/q-Exactive ; Analyse semi-quantitative de larges gammes de molécules endogènes ; Elucidation structurale par MS Haute Résolution ; Recherche de produits de métabolisation de médicaments par MS Haute Résolution ; Analyse quantitative de métabolites candidats ; Assister les scientifiques tout au long du projet métabolomique, incluant les étapes pré- et post-analytiques ; Aider à définir les questions découlant du projet et le design expérimental y répondant ; Mise en place de protocoles d'extraction adaptés à la nature des échantillons ; Intégration des données métabolomiques pour l'analyse statistique ; Aide à l'interprétation biologique, dans le contexte expérimental

Thématique : Génomique

Certification : aucune

Types d'analyses : NGS ILLUMINA ; Puces AFFYMETRIX ; PCR Dig Raindance ; PCR microfluidique Fluidigm ; Qualification Acides Nucleiques

Thématique : Imagerie cellulaire

Certification : aucune

Types d'analyses : microscopie électronique à transmission : Microscopie électronique - Imagerie - Tomographie - Ultramicrotomie - Ultrastructure - Biologie Cellulaire

Thématique : Exploration fonctionnelle

Certification : Label Medicen, ISO 9001:2008

Types d'analyses : Elevage ; Exploration fonctionnelle ; Comité d'éthique

Thématique : Imagerie cellulaire

Certification : IBISA

Types d'analyses : criblage RNAi :

Thématique : Imagerie cellulaire

Certification : aucune

Types d'analyses : biologie moléculaire : clonage, hybridation in situ, biologie moléculaire, transcription in vitro

Thématique : Maladies infectieuses

Certification : ISO 9001 V2015, IBISA

Types d'analyses : Immuno-monitorage moléculaire sur échantillons précliniques ou cliniques ; Virologie/biologie moléculaire (PCR, Q-PCR, RT-PCR) sur échantillons précliniques ou cliniques ; Etudes de pharmaco-cinétiques et de pharmaco-distributions chez les primates non Humains ; Essais vaccinaux chez les primates non Humains ; Essais thérapeutiques (anticorps, peptides, composés chimiques, nano-objects...) chez les primates non Humains ; Etudes d'immunogénicité chez les primates non Humains ; Etudes des réponses cellulaires su système immunitaire chez les primates non Humains : Cytométrie en flux ; Tri-cellulaire ; Cytométrie de masse ; Bio-informatique : stockage, analyse, modélisation des données expérimentales ; Imagerie in vivo chez les primates non Humains : fluorescence dans le proche infra-rouge ; endos-microscopie convocable ; microscopie bi-photon in vivo ; TEP-CT sur corps entiers primates non humains vivants ; RMN 7 et 11.4 Teslas (collaboration avec le département MIRCen sur le même site CEA/FAR) ; Développement de modèles animaux précliniques (primates non-humains) de différentes pathologies infectieuses

Thématique : Imagerie cellulaire

Certification : aucune

Types d'analyses : microscopie photonique : Microscopie confocale

Thématique : Imagerie in vivo

Certification : Réseau FRISBI

Types d'analyses : microscopie confocale, multiphoton et résolue en temps, interactions protéine-protéine, photoactiavation in cellulo :

Thématique : Imagerie cellulaire

Certification : Réseau France Life Imaging, réseau NeurATRIS

Types d'analyses : Micro-endoscopie, imagerie par fluorescence planaire et 3D : Cellvizio (Maunakea) Tomofluo3D (CEA/Leti)

Thématique : Imagerie cellulaire

Certification : Réseau France Life Imaging, réseau NeurATRIS

Types d'analyses : Infrastructure informatique, logiciels dédiés : Collaboration avec les équipes du CATI, traitement des données acquises sur les systèmes d'imagerie, imagerie et génétique,

Thématique : Imagerie in vivo

Certification : aucune

Types d'analyses : cytométrie et microscopie photonique : Cytométrie haut débit (16 couleurs); Tri Cellulaire (14 couleurs); Cyto imageur (Mark II) ; Microscopie confocale et haut débit

Thématique : Imagerie cellulaire

Certification : aucune

Types d'analyses : Microscopie photonique : champ large, confocal , microscopie résolue en temps, super resolution

Thématique : Imagerie cellulaire

Certification : aucune

Types d'analyses : Imagerie photonique ; Microscopie : HCA, Confocal, Champ Large, MET ; Séquençage haut débit ciblé

Thématique : Imagerie cellulaire

Certification : aucune

Types d'analyses : histologie : Histologie, analyseur d'image, numérisation

Thématique : Imagerie photonique cellulaire, tissulaire et in vivo

Certification : Label Medicen

Types d'analyses : Imagerie photonique du modèle murin au patient : Imagerie cellulaire / tissulaire, confocale et multiphotonique ; Imagerie transmodalités: organes vivants , petits animaux et imagerie photonique clinique (NIR et confocale) ; Cytométrie en flux et de masse quantitative et tri cellulaire à haut débit ; Développements innovants : nouveaux dispositifs optiques / transfert clinique de l'imagerie photonique / approche multidisciplinaire pour l'imagerie fonctionnelle à haute résolution au niveau moléculaire, cellulaire et tissulaire ; Traitement des données et quantification

Thématique : Microscopie électronique

Certification : aucune

Types d'analyses : Préparation d'échantillons en MET et en MEB ; Formations à la préparation d'échantillons et à l'observation ; Séances d'observation autonome ; Séance d'observation assistée d'un ingénieur ; Projet collaboratif à long terme

Thématique : Imagerie cellulaire

Certification : IBiSA ISO 9001:2008 - NFX 50:900, membre du PIA FranceBioImaging, Réseau EuroBioIMaging

Types d'analyses : microscopie confocale ; super-résolution PALM ; dSTORM ; SIM ; interactions moleculaires (FRET, FRAP, FLIM,FCS) ; Feuille de lumière ; imagerie in vivo ; microscopie non-lineaire multimodale (multiphoton, SHG,THG) ; Microscopie électronique à transmission ; Microscopie électronique à balayage ; Serial-Block face SEM ; Ultramicrotomie ; cryo-ultramicrotomie ; Ultrastructure ; Cytométrie en flux ; Imagerie en flux ; Tri cellulaire

Thématique : Imagerie cellulaire

Certification : IBiSA|ISO9001

Types d'analyses : Macroscopie colorant fluorescence ; Microscopie plein champ colorant fluorescence ; Microscopie confocale spinning disk L1 L2 L3 ; Microscopie multi-photonique SHG ; Imagerie en Flux ; Microscopie de super-résolution PALM STORM 3D multi-couleur ; TIRF FRET FRAP Photo-activation Photo-convertion ; Photo-dommage ; Prestations : coupe épaisse, clarification, chirurgie ; Traitement d'image ; Image Database ; Restauration d'image par déconvolution 3D en ligne

Thématique : Imagerie

Certification : ISO 9001 v2015

Types d'analyses : Imagerie photonique ; HCS ; Imagerie haute résolution spatio-temporelle ; STORM ; PALM ; 3D TIRFM ; SIM ; optogénétique ; imagerie in vivo ; etudes longitudinales SHG, THG ; Imagerie et analyse Haut Débit ; imagerie luminescence ; FMT ; CLEM

Thématique : Physiologie/Physiopathologie et Cancer/immunologie/Immunopathologie

Certification : aucune

Types d'analyses : Cytométrie en Flux, TME ; Imagerie Cell, TME

Thématique : Physiologie/Physiopathologie et Cancer/immunologie/Immunopathologie

Certification : aucune

Types d'analyses : TME

Thématique : Immuno/microenvironnement tumoral

Certification : aucune

Types d'analyses : predictive T cell assays, HLA binding, in silico prediction

Thématique : Immuno-Oncologie

Certification : aucune

Types d'analyses : multiparameter cytometry; Dry formulation of cocktail antibodies

Thématique : Cytométrie en flux

Certification : ISO 9001 version 2008

Types d'analyses : mise à disposition d'équipements (cytomètres analyseurs multi-couleurs,...) ; prestations de tri cellulaire ; prestations de multi-dosages (Luminex, MSD, Quanterix) ; prise en charge de projets d'immunobiologie (phénotypages multiparamétriques, culture cellulaire, tests de prolifération, Elispot...)

Thématique : Immunomonitoring Micro-environnement

Certification : aucune

Types d'analyses : Cytométrie, reconnaissance d'image, deep sequencing

Thématique : Immuno/microenvironnement tumoral

Certification : aucune

Types d'analyses : IHC-numerisation-analyse d'image

Thématique : Imagerie

Certification : IBiSA, France-BioImaging, Euro-BioIMaging, GDR-ImaBio, RT-MFM

Types d'analyses : MICROSCOPIE PHOTONIQUE : Mise à disposition d'équipements (vidéo-microscopie confocale, multi-photon, à feuille de lumière, super-résolue, lattice lightsheet, intravitale, FLIM…) et de logiciels d'analyse ; MICROSCOPIE PHOTONIQUE appliquée à la biologie : FRAP, optogénétique, imagerie sur échantillons vivants, photo-ablation, molécule unique, SRRF... ; MICROSCOPIE ELECTRONIQUE : Mise à disposition d'équipements pour la préparation d'échantillons, l'immunomarquage, la vitrification par haute pression, cryo-substitution de cellules, cryo-microscopie et cryo-tomographie de systèmes in vitro, et cartographie chimique ; MICROSCOPIE ELECTRONIQUE appliquée à la biologie (cryo-microscopie, tomographie et cryo-tomographie, single particle...) et microscopie corrélative (photonique, électronique) ; MICROSCOPIE A HAUT DÉBIT ET CRIBLAGE CELLULAIRE : Criblage de petites molécules et analyse des profils phénotypiques de banques d'ARNs interférents et de chimiothèques en fonction de leur intérêt théorique ; MICROSCOPIE A HAUT DÉBIT ET CRIBLAGE CELLULAIRE : Développement de tests cellulaires pour l'identification rapide et à large échelle des protéines marqueurs d'un statut physiologique ou d'une réponse fonctionnelle présentant un intérêt thérapeutique ; Formation à l'utilisation des équipements de la plateforme ; Assistance pour la mise en place d'expériences ; Analyse et traitement de données ; Développement technologique

Thématique : Imagerie cellulaire

Certification : aucune

Types d'analyses : microscopie confocale ; multiphoton ; spinning disc et macroscopie ; photo-manipulation ; TIRF ; Haute resolution : CLSM/ très haute résolution spatiale ; Imagerie in vivo ; Développpement de protocoles de clarification de tissu ; Deconvolution ; Analyse spatiale en 3D ; Etude de colocalisation

Thématique : Immuno/microenvironnement tumoral

Certification : aucune

Types d'analyses : Immunofluorescence in situ

Thématique : Immuno/microenvironnement tumoral

Certification : Elispot accrédité Cofrac

Types d'analyses : Cytomètrie-Elispot-Luminex

Thématique : Immuno/microenvironnement tumoral

Certification : aucune

Types d'analyses : Auto-immunité

Thématique : Hémato- Immuno- cytométrie fonctionnelle

Certification : aucune

Types d'analyses : Phénotypages cellulaires multicouleurs ; Signalisation cellulaire ; Cycles cellulaires ; Etude de l'apoptose, seule ou simultanément avec la chute du potentiel membranaire de la mitochondrie et la mortalité cellulaire ; L'analyse fonctionnelle de la surexpression ou de l'extinction de gènes (shRNA) ; L'étude de la prolifération cellulaire ; L'analyse et le tri des cellules souches ; L'étude des flux calciques ; …/…

Thématique : Immuno/microenvironnement tumoral

Certification : aucune

Types d'analyses : cytométrie en flux, analyses fonctionnelles (production de cytokines, fonctions NK), dosages sériques de ligands solubles NKG2D (MICA, ULBP2)

Thématique : bioinformatique

Certification : aucune

Types d'analyses : microarray CGH (Affymetrix) ; WGS ; WES ; TGS ; RNA-seq ; ChIP ; ATAC-seq ; Single-Cell ; Long-Reads ; HTG ; GeoMX

Thématique : bioinformatique

Certification : COFRAC pour certaines activités

Types d'analyses : analyse statistique de données cliniques et biologiques obtenues à partir de technologies à haut-débit telles que le séquençage, la spectrométrie de masse, les puces protéiques, le phénotypage cellulaire ou les microarrays ; NGS: WGS, exome, targeted-seq, RNAseq, sRNAseq, lncRNA, ChIPseq, Bisulfite-seq, ATACseq, HiC, *C ... ; proteomics: MS, phosphoMS, RPPA ; microarrays: SNP, copy number, expression ... ; statistics: experiment design, all classical statistical analyses ; functional analysis using reference bioinformatics databases and tools ; ...

Thématique : Génomique

Certification : aucune

Types d'analyses : Extractions d'acides nucléiques ; Qualifications (Bioanalyzer 2100, Tapestation 2200)

Thématique : Analyses NGS

Certification : aucune

Types d'analyses : Analyses NGS : ChIP-seq, RIP-Seq, lncRNA, siRNA, miRNA et RNAseq ; Impact des mutations sur le génome non codant ; Structure ARN ; Analyses fonctionnelles par profilage phylogénique