Annuaire plateformes
Le Cancéropôle Île-de-France a organisé, via son groupe de travail “Plateformes”, un recensement des plateformes technologiques franciliennes œuvrant dans le domaine de la recherche sur le cancer. Les plateformes identifiées ont été regroupées au sein d’un annuaire mis à disposition de la communauté francilienne.
Vous êtes responsable d’une plateforme technologique francilienne et êtes impliqué dans la recherche sur le cancer ? Vous souhaitez figurer dans cet annuaire ?
Nous vous remercions de renseigner le formulaire dédié.
Pour toute question, n’hésitez pas à nous contacter à l’adresse communication@canceropole-idf.fr.
63 résultats
Thématique : Cytométrie, Immunophénotypage, Protéomique, Single Cell, Spatial
Certification : IBISA
Types d'analyses : Analyses phénotypiques de biomarqueurs circulants, vésicules extracellulaires, cellules et tissus ; Approches simplex ou multiplex à la résolution single cell ; Cytométrie conventionnelle, spectrale, en image et spatiale ; Tris cellulaires en bulk, monoclonal ou single cell ; Mise à disposition, assistance ou collaboration ; Formation à l'utilisation des instruments et des logiciels d'analyse ; Accompagnement dans l'élaboration des expériences (protocole, panel design, instrumentation adaptée, analyse, …) ; Organisation de workshops, webinaires, séminaires, tutorials, … ; Travail en synergie avec des plateformes complémentaires (NGS, Bioinformatic, CustomSingleCell, ExtraCellular Vesicles, …)
Thématique : Cytométrie et Imagerie
Certification : aucune
Types d'analyses : Cytométrie de masse ; Imagerie multiparamétrique (37 marqueurs simultanéement) ; Cytométrie spectrale ; Tri cellulaire ; Tri cellulaire infectieux ; Tri cellulaire humain
Thématique : Radiothérapie
Certification : aucune
Types d'analyses : Irradiation ; Dosimétrie ; Étalonnage de détecteurs
Thématique : Génomique et transcriptomique
Certification : aucune
Types d'analyses : Conseil en génomique ; Préparation d'échantillon (cryo-section, microdissection laser, purification d'acides nucleiques) ; Analyse Génomique (genome wide par analyse en micorarray, analyse de mutations ponctuelles, de polymorphismes) ; Analyse Transcriptomique: de genome entier, or analyse ciblée (Nanostring), test de signature transcriptomique ; Analyse de la régulation de l'expression des gènes: miRNA, ncRNA, analyse de la méthylation (OxBS), analyse de la conformation de la chromatine
Thématique : Génomique, Next Generation Sequencing
Certification : Membre du réseau France Génomique
Types d'analyses : Génomique : WGS, WES, targeted sequencing ; Transcriptomique : RNAseq, small RNAseq, single cell RNAseq ; Epigénétique : ChIPseq, ATACseq, WGBS, HiC, ...
Thématique : Génomique
Certification : ISO9001
Types d'analyses : qPCR au format 1536 puits ; Séquençage moyen débit ; NGS (exomes, Custom Capture, target amplicon, RNAseq, MethylSeq,...) ; Génotypage ; Purification et analyse des produits de PCR
Thématique : Génomique
Certification : ISO9001, NFX 50900
Types d'analyses : Puces ADN (Illumina, Génotypage et Transcriptome) ; NGS
Thématique : Génomique fonctionnelle
Certification : ISO 9001 (mars 2013), NF X50-900 (avril 2015)
Types d'analyses : Séquençage à haut débit en génomique fonctionnelle (RNA-Seq, ChIP-Seq)
Thématique : Génomique
Certification : ISO 9001
Types d'analyses : qPCR à haut débit : CNV, SNP, génotypage, PCR digitale ; Préparation de banques pour séquençage (système Acces Array) ; Analyses Bio-statistiques
Thématique : Génomique
Certification : aucune
Types d'analyses : Séquençage haut débit NGS (Whole Genome, Exome, RNA-seq, ChIP-seq, target resequencing) ; Technologies d'hybridation sur puces
Thématique : Génomique et transcriptomique
Certification : ISO 9001 V2
Types d'analyses : puces à ADN (transcriptome principalement) : production de données et analyse suivant prestations de service / 1700 échantillons en 2016 / 80 projets traités / 12 publications ; Analyses ciblées par PCR temps réel et technologie Nanostring : production de données et analyse sous forme de prestations, formation des utilisateurs ; NGS (séquençage ciblé, exome, RNAseq, ..) : production de données et analyse suivant prestations de service et sous forme de gestion de projets / 900 échantillons en 2016 / 30 projets traités ; contrôle qualité des ARN sous forme de prestations de service
Thématique : Génomique
Certification : aucune
Types d'analyses : QPCR haut débit ; NGS
Thématique : Protéomique, spectrométrie de masse
Certification : IBISA
Types d'analyses : Shotgun Proteomic analysis ; Identification : complex samples (crude cell extracts) ; IP and co-IP ; Purified proteins (QC) ; Post-translational modifications : Phosphoproteome ; Ubiquitome/Sumoylome ; Methylation/ Acetylation ; Glycosylation ; Glycans ; Glycopeptides ; Quantification ; SILAC, pulsed SILAC, iTRAQ, TMT, label free, SLIM-labeling ; Targeted quantification : PRM ; Glycans quantification ; Top-down Protein analysis : infusion or in LC-MSMS mode ; Sample preparation
Thématique : Protéomique
Certification : ISO 9001, IBISA
Types d'analyses : Identification et caractérisation de protéines dans des fragments de gels ou en solution : recherche de partenaires protéiques ; Analyse de fractions sub-cellulaires dont sécrétomes et microvésicules ; Analyse des modifications post-traductionnelles globales ou ciblées : phosphorylations, méthylations, acétylations ; Analyses quantitatives globales par méthode "LabelFree" ou par marquage (SILAC, ITRAQ, TMT) ; Analyses quantitatives ciblées MRM, PRM ; Immunoanalyse ciblée d'expression protéique ou de modifications post-traductionnelles entraînant des modifications de pI
Thématique : Protéomique
Certification : aucune
Types d'analyses : Electrophoresis 1D/2D ; Liquid chromatography ; Mass spectrometry
Thématique : Protéomique
Certification : aucune
Types d'analyses : Biochimie des protéines SDS-PAGE ; Spectrométrie de masse ; Séparation HPLC (nano / micro) ; Techniques de purification
Thématique : Protéomique
Certification : Global RPPA Society
Types d'analyses : Conseils sur votre design expérimental, participation à l'écriture de votre demande de financement (le cas échéant). ; Validation de nouveaux anticorps primaires ; Prise en charge des échantillons (lyse protéique, dosage par kit BCA) ; Création des puces (préparation des plaques 384 puits, dépôt sur puce en plusieurs dilutions et plusieurs réplicats par échantillon) ; Révélation des puces avec les anticorps primaires de votre choix ; Lecture des puces, quantification du signal ; Un contrôle qualité semi-automatisé des données ; Normalisation des données ; Analyses exploratoires (ACP et clustering hiérarchique) et analyses différentielles selon vos questions biologiques ; Assistance lors de l'écriture de votre publication ; Stockage sécurisé des échantillons et des données pendant au moins 3 ans
Thématique : Protéomique
Certification : aucune
Types d'analyses : LC-MS/MS
Thématique : Protéomique
Certification : aucune
Types d'analyses : Mass Spectrometry (MS) ; nanoLC-MS-MS Tandem Mass spectrometry ; Tandem Mass spectrometry (MS-MS)
Thématique : Protéomique
Certification : aucune
Types d'analyses : LC-MS/MS ; MALDI-TOF/TOF ; MALDI-TOF ; 2D-DIGE ; 2D gels and/or LC-MS/MS ; MALDI-TOF
Thématique : Protéomique
Certification : IBISA
Types d'analyses : Définition et conception du dessin expérimental ; Conseils concernant la mise en place du projet ; Conseils et aide à la préparation de l'échantillon / contrôle qualité ; Identification des protéines et peptides ; Comparaison de protéomes ; Mesure de masse à haute résolution ; Analyse des modifications post-traductionnelles (localisation et caractérisation) ; Protéomique ciblée ; Protéomique quantitative (SILAC, DIA, Label free…) ; Traitement des données ; Analyse bioinformatique et statistique
Thématique : Protéomique
Certification : IBiSA
Types d'analyses : nanoLC MS/MS ; Proteolysis ; MALDI/ESI MS/MS ; SILAC, label free quantification, TMT ; redoxomic ; glycomics ; whole protein analysis and identification
Thématique : Protéomique
Certification : aucune
Types d'analyses : couplage LC-MS
Thématique : Métabolomique
Certification : aucune
Types d'analyses : Mass Spectrometry
Thématique : Métabolomique
Certification : IBISA
Types d'analyses : LC/HRMS, MALDI-TOF/TOF
Thématique : Métabolomique
Certification : aucune
Types d'analyses : Profilage non-biaisé d'échantillons biologiques par UHPLC/q-Exactive ; Analyse semi-quantitative de larges gammes de molécules endogènes ; Elucidation structurale par MS Haute Résolution ; Recherche de produits de métabolisation de médicaments par MS Haute Résolution ; Analyse quantitative de métabolites candidats ; Assister les scientifiques tout au long du projet métabolomique, incluant les étapes pré- et post-analytiques ; Aider à définir les questions découlant du projet et le design expérimental y répondant ; Mise en place de protocoles d'extraction adaptés à la nature des échantillons ; Intégration des données métabolomiques pour l'analyse statistique ; Aide à l'interprétation biologique, dans le contexte expérimental
Thématique : Génomique
Certification : aucune
Types d'analyses : NGS ILLUMINA ; Puces AFFYMETRIX ; PCR Dig Raindance ; PCR microfluidique Fluidigm ; Qualification Acides Nucleiques
Thématique : Imagerie cellulaire
Certification : aucune
Types d'analyses : microscopie électronique à transmission : Microscopie électronique - Imagerie - Tomographie - Ultramicrotomie - Ultrastructure - Biologie Cellulaire
Thématique : Exploration fonctionnelle
Certification : Label Medicen, ISO 9001:2008
Types d'analyses : Elevage ; Exploration fonctionnelle ; Comité d'éthique
Thématique : Imagerie cellulaire
Certification : IBISA
Types d'analyses : criblage RNAi :
Thématique : Imagerie cellulaire
Certification : aucune
Types d'analyses : biologie moléculaire : clonage, hybridation in situ, biologie moléculaire, transcription in vitro
Thématique : Maladies infectieuses
Certification : ISO 9001 V2015, IBISA
Types d'analyses : Immuno-monitorage moléculaire sur échantillons précliniques ou cliniques ; Virologie/biologie moléculaire (PCR, Q-PCR, RT-PCR) sur échantillons précliniques ou cliniques ; Etudes de pharmaco-cinétiques et de pharmaco-distributions chez les primates non Humains ; Essais vaccinaux chez les primates non Humains ; Essais thérapeutiques (anticorps, peptides, composés chimiques, nano-objects...) chez les primates non Humains ; Etudes d'immunogénicité chez les primates non Humains ; Etudes des réponses cellulaires su système immunitaire chez les primates non Humains : Cytométrie en flux ; Tri-cellulaire ; Cytométrie de masse ; Bio-informatique : stockage, analyse, modélisation des données expérimentales ; Imagerie in vivo chez les primates non Humains : fluorescence dans le proche infra-rouge ; endos-microscopie convocable ; microscopie bi-photon in vivo ; TEP-CT sur corps entiers primates non humains vivants ; RMN 7 et 11.4 Teslas (collaboration avec le département MIRCen sur le même site CEA/FAR) ; Développement de modèles animaux précliniques (primates non-humains) de différentes pathologies infectieuses
Thématique : Imagerie cellulaire
Certification : aucune
Types d'analyses : microscopie photonique : Microscopie confocale
Thématique : Imagerie in vivo
Certification : Réseau FRISBI
Types d'analyses : microscopie confocale, multiphoton et résolue en temps, interactions protéine-protéine, photoactiavation in cellulo :
Thématique : Imagerie cellulaire
Certification : Réseau France Life Imaging, réseau NeurATRIS
Types d'analyses : Micro-endoscopie, imagerie par fluorescence planaire et 3D : Cellvizio (Maunakea) Tomofluo3D (CEA/Leti)
Thématique : Imagerie cellulaire
Certification : Réseau France Life Imaging, réseau NeurATRIS
Types d'analyses : Infrastructure informatique, logiciels dédiés : Collaboration avec les équipes du CATI, traitement des données acquises sur les systèmes d'imagerie, imagerie et génétique,
Thématique : Imagerie in vivo
Certification : aucune
Types d'analyses : cytométrie et microscopie photonique : Cytométrie haut débit (16 couleurs); Tri Cellulaire (14 couleurs); Cyto imageur (Mark II) ; Microscopie confocale et haut débit
Thématique : Imagerie cellulaire
Certification : aucune
Types d'analyses : Microscopie photonique : champ large, confocal , microscopie résolue en temps, super resolution
Thématique : Imagerie cellulaire
Certification : aucune
Types d'analyses : Imagerie photonique ; Microscopie : HCA, Confocal, Champ Large, MET ; Séquençage haut débit ciblé
Thématique : Imagerie cellulaire
Certification : aucune
Types d'analyses : histologie : Histologie, analyseur d'image, numérisation
Thématique : Imagerie photonique cellulaire, tissulaire et in vivo
Certification : Label Medicen
Types d'analyses : Imagerie photonique du modèle murin au patient : Imagerie cellulaire / tissulaire, confocale et multiphotonique ; Imagerie transmodalités: organes vivants , petits animaux et imagerie photonique clinique (NIR et confocale) ; Cytométrie en flux et de masse quantitative et tri cellulaire à haut débit ; Développements innovants : nouveaux dispositifs optiques / transfert clinique de l'imagerie photonique / approche multidisciplinaire pour l'imagerie fonctionnelle à haute résolution au niveau moléculaire, cellulaire et tissulaire ; Traitement des données et quantification
Thématique : Microscopie électronique
Certification : aucune
Types d'analyses : Préparation d'échantillons en MET et en MEB ; Formations à la préparation d'échantillons et à l'observation ; Séances d'observation autonome ; Séance d'observation assistée d'un ingénieur ; Projet collaboratif à long terme
Thématique : Imagerie cellulaire
Certification : IBiSA ISO 9001:2008 - NFX 50:900, membre du PIA FranceBioImaging, Réseau EuroBioIMaging
Types d'analyses : microscopie confocale ; super-résolution PALM ; dSTORM ; SIM ; interactions moleculaires (FRET, FRAP, FLIM,FCS) ; Feuille de lumière ; imagerie in vivo ; microscopie non-lineaire multimodale (multiphoton, SHG,THG) ; Microscopie électronique à transmission ; Microscopie électronique à balayage ; Serial-Block face SEM ; Ultramicrotomie ; cryo-ultramicrotomie ; Ultrastructure ; Cytométrie en flux ; Imagerie en flux ; Tri cellulaire
Thématique : Imagerie cellulaire
Certification : IBiSA|ISO9001
Types d'analyses : Macroscopie colorant fluorescence ; Microscopie plein champ colorant fluorescence ; Microscopie confocale spinning disk L1 L2 L3 ; Microscopie multi-photonique SHG ; Imagerie en Flux ; Microscopie de super-résolution PALM STORM 3D multi-couleur ; TIRF FRET FRAP Photo-activation Photo-convertion ; Photo-dommage ; Prestations : coupe épaisse, clarification, chirurgie ; Traitement d'image ; Image Database ; Restauration d'image par déconvolution 3D en ligne
Thématique : Imagerie
Certification : ISO 9001 v2015
Types d'analyses : Imagerie photonique ; HCS ; Imagerie haute résolution spatio-temporelle ; STORM ; PALM ; 3D TIRFM ; SIM ; optogénétique ; imagerie in vivo ; etudes longitudinales SHG, THG ; Imagerie et analyse Haut Débit ; imagerie luminescence ; FMT ; CLEM
Thématique : Physiologie/Physiopathologie et Cancer/immunologie/Immunopathologie
Certification : aucune
Types d'analyses : Cytométrie en Flux, TME ; Imagerie Cell, TME
Thématique : Physiologie/Physiopathologie et Cancer/immunologie/Immunopathologie
Certification : aucune
Types d'analyses : TME
Thématique : Immuno/microenvironnement tumoral
Certification : aucune
Types d'analyses : predictive T cell assays, HLA binding, in silico prediction
Thématique : Immuno-Oncologie
Certification : aucune
Types d'analyses : multiparameter cytometry; Dry formulation of cocktail antibodies
Thématique : Cytométrie en flux
Certification : ISO 9001 version 2008
Types d'analyses : mise à disposition d'équipements (cytomètres analyseurs multi-couleurs,...) ; prestations de tri cellulaire ; prestations de multi-dosages (Luminex, MSD, Quanterix) ; prise en charge de projets d'immunobiologie (phénotypages multiparamétriques, culture cellulaire, tests de prolifération, Elispot...)
Thématique : Immunomonitoring Micro-environnement
Certification : aucune
Types d'analyses : Cytométrie, reconnaissance d'image, deep sequencing
Thématique : Immuno/microenvironnement tumoral
Certification : aucune
Types d'analyses : IHC-numerisation-analyse d'image
Thématique : Imagerie
Certification : IBiSA, France-BioImaging, Euro-BioIMaging, GDR-ImaBio, RT-MFM
Types d'analyses : MICROSCOPIE PHOTONIQUE : Mise à disposition d'équipements (vidéo-microscopie confocale, multi-photon, à feuille de lumière, super-résolue, lattice lightsheet, intravitale, FLIM…) et de logiciels d'analyse ; MICROSCOPIE PHOTONIQUE appliquée à la biologie : FRAP, optogénétique, imagerie sur échantillons vivants, photo-ablation, molécule unique, SRRF... ; MICROSCOPIE ELECTRONIQUE : Mise à disposition d'équipements pour la préparation d'échantillons, l'immunomarquage, la vitrification par haute pression, cryo-substitution de cellules, cryo-microscopie et cryo-tomographie de systèmes in vitro, et cartographie chimique ; MICROSCOPIE ELECTRONIQUE appliquée à la biologie (cryo-microscopie, tomographie et cryo-tomographie, single particle...) et microscopie corrélative (photonique, électronique) ; MICROSCOPIE A HAUT DÉBIT ET CRIBLAGE CELLULAIRE : Criblage de petites molécules et analyse des profils phénotypiques de banques d'ARNs interférents et de chimiothèques en fonction de leur intérêt théorique ; MICROSCOPIE A HAUT DÉBIT ET CRIBLAGE CELLULAIRE : Développement de tests cellulaires pour l'identification rapide et à large échelle des protéines marqueurs d'un statut physiologique ou d'une réponse fonctionnelle présentant un intérêt thérapeutique ; Formation à l'utilisation des équipements de la plateforme ; Assistance pour la mise en place d'expériences ; Analyse et traitement de données ; Développement technologique
Thématique : Imagerie cellulaire
Certification : aucune
Types d'analyses : microscopie confocale ; multiphoton ; spinning disc et macroscopie ; photo-manipulation ; TIRF ; Haute resolution : CLSM/ très haute résolution spatiale ; Imagerie in vivo ; Développpement de protocoles de clarification de tissu ; Deconvolution ; Analyse spatiale en 3D ; Etude de colocalisation
Thématique : Immuno/microenvironnement tumoral
Certification : aucune
Types d'analyses : Immunofluorescence in situ
Thématique : Immuno/microenvironnement tumoral
Certification : Elispot accrédité Cofrac
Types d'analyses : Cytomètrie-Elispot-Luminex
Thématique : Immuno/microenvironnement tumoral
Certification : aucune
Types d'analyses : Auto-immunité
Thématique : Hémato- Immuno- cytométrie fonctionnelle
Certification : aucune
Types d'analyses : Phénotypages cellulaires multicouleurs ; Signalisation cellulaire ; Cycles cellulaires ; Etude de l'apoptose, seule ou simultanément avec la chute du potentiel membranaire de la mitochondrie et la mortalité cellulaire ; L'analyse fonctionnelle de la surexpression ou de l'extinction de gènes (shRNA) ; L'étude de la prolifération cellulaire ; L'analyse et le tri des cellules souches ; L'étude des flux calciques ; …/…
Thématique : Immuno/microenvironnement tumoral
Certification : aucune
Types d'analyses : cytométrie en flux, analyses fonctionnelles (production de cytokines, fonctions NK), dosages sériques de ligands solubles NKG2D (MICA, ULBP2)
Thématique : bioinformatique
Certification : aucune
Types d'analyses : microarray CGH (Affymetrix) ; WGS ; WES ; TGS ; RNA-seq ; ChIP ; ATAC-seq ; Single-Cell ; Long-Reads ; HTG ; GeoMX
Thématique : bioinformatique
Certification : COFRAC pour certaines activités
Types d'analyses : analyse statistique de données cliniques et biologiques obtenues à partir de technologies à haut-débit telles que le séquençage, la spectrométrie de masse, les puces protéiques, le phénotypage cellulaire ou les microarrays ; NGS: WGS, exome, targeted-seq, RNAseq, sRNAseq, lncRNA, ChIPseq, Bisulfite-seq, ATACseq, HiC, *C ... ; proteomics: MS, phosphoMS, RPPA ; microarrays: SNP, copy number, expression ... ; statistics: experiment design, all classical statistical analyses ; functional analysis using reference bioinformatics databases and tools ; ...
Thématique : Génomique
Certification : aucune
Types d'analyses : Extractions d'acides nucléiques ; Qualifications (Bioanalyzer 2100, Tapestation 2200)
Thématique : Analyses NGS
Certification : aucune
Types d'analyses : Analyses NGS : ChIP-seq, RIP-Seq, lncRNA, siRNA, miRNA et RNAseq ; Impact des mutations sur le génome non codant ; Structure ARN ; Analyses fonctionnelles par profilage phylogénique