La plateforme de cytogénétique, PF-CytoG, du Département de Radiobiologie Cellulaire et Moléculaire (DRCM) du CEA est spécialisée dans l’analyse des chromosomes et de leurs anomalies, qu’elles soient numériques ou structurales. La plateforme met son expertise à disposition des équipes scientifiques académiques et industrielles en proposant des prestations de cytogénétique adaptées à divers projets de recherche.
Les analyses cytogénétiques contribuent à la caractérisation des cellules traitées par des molécules chimiques ou issues d’ingénierie génétique, et assurent le contrôle qualité de la stabilité chromosomique au cours des cultures cellulaires. A partir de différents types d’échantillons (lignées cellulaires, cultures primaires, cellules souches pluripotentes iPSC, sang, organoïdes), la plateforme réalise des étalements de chromosomes métaphasiques et met en oeuvre plusieurs techniques de cytogénétique moléculaire par Fluorescent In Situ Hybridization (FISH). Elle propose notamment d’établir le caryotype par Multi-FISH (M-FISH) à l’aide de sondes commerciales, ainsi que l’analyse ciblée de régions chromosomiques spécifiques (télomères, centromères). Ces approches permettent d’étudier les réarrangements chromosomiques, et les aberrations télomériques, de suivre l’évolution de la taille des séquences télomériques par Télo/Centro-FISH, et d’analyser les recombinaisons télomériques entre chromatides sœurs par Chromosome Orientation-FISH (CO-FISH).
La plateforme réalise également des techniques de cytogénétique conventionnelle comme la coloration Giemsa avec détection automatique des chromosomes dicentriques. Combinée à l’incorporation d’analogue de thymidine, la coloration Giemsa permet de suivre les échanges entre chromatides sœurs (SCE), un marqueur de la toxicologie génétique d’un produit.
La plateforme qui travaille avec une enceinte climatique garantissant la qualité et la reproductibilité des étalements de chromosomes métaphasiques, dispose d’un équipement de pointe incluant un microscope Zeiss Imager.Z2, un bras robotisé et des logiciels spécialisés permettant la détection automatisée des métaphases et l’acquisition d’images à haut débit avec une capacité allant jusqu’à 80 lames.
Enfin, la plateforme Cyto-G travaille en étroite collaboration avec les autres plateformes du DRCM afin de proposer des solutions intégrées et sur mesure, adaptées aux besoins scientifiques de chaque projet.
Mots clés : Etalement de chromosomes métaphasiques, Détection automatisée des métaphases, Caryotype, Multi-FISH, Télomère, Centromère, Télomère-Centromère-FISH, CO-FISH, Echange entre chromatides soeurs, SCE, Aberration chromosomique, Aberration télomérique, Détection automatisée des dicentriques
