Technologies & Synergies

Groupe de travail du Cancéropôle IDF

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Annuaire des plateformes technologiques d'IDF

Le Cancéropôle Île-de-France a organisé un recensement des plateformes technologiques franciliennes œuvrant dans le domaine de la recherche sur le cancer. Les plateformes identifiées ont été regroupées au sein d’un annuaire mis à disposition de la communauté francilienne.

Vous êtes responsable d’une plateforme technologique francilienne impliquée dans la recherche sur le cancer ?
Vous souhaitez faire figurer votre plateforme dans cet annuaire ?
➡️ Nous vous remercions de renseigner le formulaire dédié.

Si vous souhaitez modifier les informations d’une plateforme figurant déjà dans l’annuaire ou pour toute question, contactez-nous à l’adresse communication@canceropole-idf.fr. 
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Showing Plateformes 1-10 of 46

Single Cell Initiative

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Omique
 – génomique, transcriptomique, épigénomique, protéomique, bio-informatique, cytométrie
Certification : IBiSA,ISO9001
Type d’analyses : Conventional, spectral and imaging cytometry Cell sorting Single cell isolation Single cell RNA-seq: 3′ scRNA seq, 5′ scRNA seq + V(D)J (TCR/BCR), Smart-seq3/ Flash-seq, CITE-seq (scRNA-seq + protein detection) Single cell ATAC-seq Single Cell multiome (scATAC-seq+scRNA-seq) Single cell ChIP-seq Single cell CUT&Tag Single cell Copy Number Variation (scCNV) Spatial transcriptomics, both sequencing-based and imaging-based Spatial proteomics (non-cyclic multiplexed immunofluorescence) Bioinformatics pipelines and analysis for all applications
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CyPS

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Phénotypage cellulaire
 – Cytométrie
Certification : aucune
Type d’analyses : Cytométrie de masse — plus de 50 marqueurs simultanément Imagerie multiparamétrique — plus de 40 marqueurs simultanément Tri spectral avec ou sans traitement d’images Tri infectieux — agents de classe 2 et certains agents de classe 3 Tri d’OGM — classes 1 et 2 Conception et optimisation des panels Analyse avancée des données Formations personnalisées
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CYMAGES Plateforme d’imagerie et cytométrie

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Imagerie cellulaire et Phénotypage cellulaire
 – imagerie photonique, analyse multiplexe, cytométrie en flux
Certification : aucune
Type d’analyses : Les missions de CYMAGES sont multiples : Orientation des utilisateurs vers l’équipement le plus adapté à leur problématique. Aide à la mise en place de l’expérience : choix des fluorochromes, choix des contrôles, … Mise à disposition d’équipements fonctionnels et calibrés. Formation des utilisateurs pour une utilisation autonome des équipements. Prise en charge des acquisitions pour les utilisateurs non autonomes. Aide au traitement et à l’analyse des données obtenues. Aide à l’interprétation et présentation des résultats. La plateforme CYMAGES propose 3 types de prestations : L’utilisation autonome des équipements L’utilisation assistée des équipements Le projet collaboratif
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Plateforme d’imagerie biophotonique et d’imagerie cellulaire @LBPA

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Imagerie cellulaire
 – Imagerie cellulaire
Certification : aucune
Type d’analyses : Biophotonique – fluorescence résolue en temps : Mesures de fluorescence résolue en temps durées de vie, anisotropie-temps de corrélation rotationnels Spectroscopie de corrélation (croisée) de fluorescence (FCS et FCCS) Microscopies confocale & multiphotonique Photoactivation multiphotonique FLIM (imagerie en temps de vie de fluorescence) FRET TIRF observation de phénomènes biologiques et biophysiques, intra et intercellulaires
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MIPSIT Imagerie Cellulaire @IPSIT

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Imagerie cellulaire
 – Imagerie cellulaire
Certification : aucune
Type d’analyses : La plateforme propose différentes prestations: – Formation : pour l’utilisation autonome des différents systèmes de la plateforme. – Collaboration : selon la demande, accompagnement scientifique et technique, réalisation de tout ou partie des expériences et analyses nécessaires à la réalisation du projet. – Prestation de services (uniquement pour les entreprises privées) Type d’analyses : imagerie cellulaire et tissulaire microscopie confocale Microscopie plein champ Vidéomicroscopie Microscope à feuillet de lumière (LightSheet) Super résolution (STED) imagerie 3D Analyse et traitement de l’image Imaris Huygens ImageJ
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UTechS PBI – BioImagerie Photonique

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Imagerie cellulaire
 – Imagerie cellulaire
Certification : ISO9001
Type d’analyses : La R&D est fondée sur la nécessité de développer des méthodes d’imagerie optique qui apportent une nouvelle compréhension des interactions hôte-pathogène et des techniques d’imagerie à haut contenu et leur application à l’infection, à la biologie cellulaire, à la microbiologie cellulaire et à la microbiologie. Nous travaillons sur de nouvelles techniques extrapolant des informations quantitatives des dynamiques spatio-temporelles in situ et nous repoussons les limites des approches existantes pour améliorer leurs performances élargissant ainsi leur utilité expérimentale. Prestations, utilisation autonome des microscopes, formations et opendesk
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CUBIC – CurieCoreTech @Bioinformatique

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Bioinformatique
 – bioinformatique
Certification : aucune
Type d’analyses : Analyse de données bioinformatiques et biostatistiques, incluant mais non limités à la recherche clinique, l’épigénomique, l’analyse en cellule unique, la spectrometrie de masse, le phénotypage cellulaire Gestion de données Formations en bioinformatique et biostatistique Ingénierie logicielle, calcul scientifique, optimisation de pipeline Accès aux logiciels d’analyse développés en interne
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Genomique ENS

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Omique
 – Génomique
Certification : IBiSA,ISO9001
Type d’analyses : Séquençage à haut débit et applications de génomique fonctionnelle : Transcriptome eucaryote : RNA-seq (faibles quantités, lectures courtes et longues) Transcriptome eucaryote en cellule unique : scRNA-seq (lectures courtes et longues) Régulome eucaryote : Méthylation de l’ARN m6A (lectures longues) Fabrication de banques, séquençage, analyses bioinformatiques Service de séquençage « ready-to-load » (y compris non eucaryote) pour les utilisateurs qui réalisent eux même leurs banques
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qPCR-HD-GPC ENS – Plateforme de PCR Quantitative Haut Débit

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Omique
 – Génomique, PCR
Certification : IBiSA
Type d’analyses : Analyses génomiques quantitatives par qPCR en microfluidique : Variation d’expression ADN génomique Préparation de banques Transcriptomique Quantification absolue Analyses génomiques par PCR digitale : Quantification absolue des acides nucléiques (ADN, ARN). Médecine personnalisée en oncologie (suivi des patients à partir de simples prises de sang). Contrôle des thérapies géniques et/ou cellulaires. Génotypage des lignées animales ou cellulaires. Analyse des anomalies chromosomiques (CNV) et de la présence de polymorphismes (SNP). Surveillance de pathogènes dans les eaux usées, identification de variants génétiques viraux. Détection d’évènements rares. Identification de biomarqueurs présents en faibles quantités dans des fluides biologiques (sang, urine, salive) ou environnementaux. Capacité de multiplexage offrant la possibilité de caractériser simultanément plusieurs éléments génétiques dans un même échantillon (3 à 6 canaux de détection), permettant l’utilisation optimale d’échantillons précieux et/ou rares. Encapsulation et amplification sur noyaux ou cellules uniques.
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