Les spectromètres de masse équipant la plateforme métabolomique permettent la mesure de toutes les classes potentielles de métabolites, aussi bien pour des approches ciblées que non ciblées.
Le profilage (non-ciblé) est réalisé au moyen d’un spectromètre de masse haute résolution (high resolution mass spectrometer, HRMS) couplé à une chromatographie ultra haute performance (ultra-high performance liquid chromatography, UHPLC).
L’analyse métabolomique ciblée repose sur la technique MRM (multiple reaction monitoring) après séparation par UHPLC, en fonction des propriétés du métabolite d’intérêt.
Nous quantifions en routine acides aminés et dérivés, acides gras, acyl-carnitines, nucléotides, co-facteurs, vitamines, lipides neutres et les molécules de la glycolyse et du cycle de Krebs, ainsi que les tri/di/mono-acylglycerides.
Les analyses peuvent être effectuées sur divers types d’extraits d’échantillons biologiques, dans un contexte clinique et pré-clinique, comme des biofluides, contenus fecaux et tissus issus de cohortes humaines, d’expérimentations animales ou des cellules en culture (adhérentes ou en suspension).
La technologie d’imagerie par spectrométrie de masse permet à la plateforme d’analyser de manière non-biaisée la distribution spatiale de milliers de métabolites, au sein de tissus biologiques et de cultures cellulaires.
La plateforme rassemble tous les moyens techniques requis lors d’un projet métabolomique, depuis l’extraction des métabolites de la matrice biologique jusqu’à l’analyse des données et le rendu des résultats.
