Type d’analyses : Profilage non-biaisé d’échantillons biologiques par UHPLC/q-Exactive Analyse semi-quantitative de larges gammes de molécules endogènes Elucidation structurale par MS Haute Résolution Recherche de produits de métabolisation de médicaments par MS Haute Résolution Analyse quantitative de métabolites candidats Assister les scientifiques tout au long du projet métabolomique, incluant les étapes pré- et post-analytiques Aider à définir les questions découlant du projet et le design expérimental y répondant Mise en place de protocoles d’extraction adaptés à la nature des échantillons Intégration des données métabolomiques pour l’analyse statistique Aide à l’interprétation biologique, dans le contexte expérimental

Type d’analyses : Production de données omiques (métabolomiques, lipidomiques, glycomiques) non ciblées par chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse à haute résolution, Traitement de données omiques, du pré-processing à l’analyse statistique, Imagerie par spectrométrie de masse, Quantification absolue par chromatographie liquide couplée à la spectrométrie de masse de métabolites et de petites molécules, dont les médicaments et leurs métabolites, Traitement d’un large panel d’échantillons : biofluides (plasma, sérum, liquide cérébrospinal), tissus, bactéries…

Type d’analyses : Définition et conception du dessin expérimental Conseils concernant la mise en place du projet Conseils et aide à la préparation de l’échantillon / contrôle qualité Identification des protéines et peptides Comparaison de protéomes Mesure de masse à haute résolution Analyse des modifications post-traductionnelles (localisation et caractérisation) Protéomique ciblée Protéomique quantitative (SILAC, DIA, Label free…) Traitement des données Analyse bioinformatique et statistique

Type d’analyses : Mass Spectrometry (MS) nanoLC-MS-MS Tandem Mass spectrometry Tandem Mass spectrometry (MS-MS)

Type d’analyses : Biochimie des protéines SDS-PAGE Spectrométrie de masse Séparation HPLC (nano / micro) Techniques de purification

Type d’analyses : Identification et caractérisation de protéines dans des fragments de gels ou en solution : recherche de partenaires protéiques ; Analyse de fractions sub-cellulaires dont sécrétomes et microvésicules Analyse des modifications post-traductionnelles globales ou ciblées : phosphorylations, méthylations, acétylations Analyses quantitatives globales par méthode « LabelFree » ou par marquage (SILAC, ITRAQ, TMT) Analyses quantitatives ciblées MRM, PRM Immunoanalyse ciblée d’expression protéique ou de modifications post-traductionnelles entraînant des modifications de pI

Type d’analyses : Shotgun Proteomic analysis Identification : complex samples (crude cell extracts) ; IP and co-IP ; Purified proteins (QC) Post-translational modifications : Phosphoproteome ; Ubiquitome/Sumoylome ; Methylation/ Acetylation ; Glycosylation ; Glycans ; Glycopeptides Quantification SILAC, pulsed SILAC, iTRAQ, TMT, label free, SLIM-labeling Targeted quantification : PRM Glycans quantification Top-down Protein analysis : infusion or in LC-MSMS mode Sample preparation

Type d’analyses : – nanoLC MS/MS – Proteolysis – MALDI/ESI MS/MS – SILAC, label free quantification, TMT – redoxomic – glycomics – whole protein analysis and identification