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NOS ACTIONS D'Accompagnement

Pour accompagner un maximum de chercheurs de son territoire, le Cancéropôle Île-de-France propose aux cliniciens et chercheurs des formations et des outils pratiques ayant pour objectif de les aider à améliorer leurs pratiques.

  • Formations : en format présentiel ou MOOC, elles ont pour objectif d’apporter aux chercheurs franciliens travaillant dans le domaine du cancer de nouvelles compétences ;
  • Outils pratiques : développés par les groupes de travail, ces annuaires, atlas ou diagrammes méthodologiques, ils sont disponibles en libre accès.

Visualisation de données génomiques avec UCSC

En complément de nos formations NGS & Cancer dédiées à l’apprentissage d’analyse de données NGS avec R et R Studio, nous vous proposons de vous familiariser avec l’outil d’analyse bio-informatique Galaxy de manière autonome via ces vidéos tutorielles.

Programme
DE LA FORMATION EN LIGNE

  1. Introduction à Galaxy
  2. Analyses DNA-Seq
  3. Analyses RNA-Seq
  4. Analyses épigénomiques
  5. Utilisation des bases de données
  6. Visualisation de données génomiques

Visualisez vos données génomiques par utilisation du Genome Browser UCSC.

Formateur : Yannick Boursin, Gustave Roussy.

Durée : 20:22

À télécharger pour l’exercice :

  • Données test :
    • Variants : .zip, 9,2 Mo
    • RNA-Seq : .zip, 231,7 Mo
    • ChIP-Seq : .zip, 3,3 Mo

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