Technologies & Synergies

Groupe de travail du Cancéropôle IDF

Annuaire des plateformes technologiques d'IDF

Le Cancéropôle Île-de-France a organisé un recensement des plateformes technologiques franciliennes œuvrant dans le domaine de la recherche sur le cancer. Les plateformes identifiées ont été regroupées au sein d’un annuaire mis à disposition de la communauté francilienne.

Vous êtes responsable d’une plateforme technologique francilienne impliquée dans la recherche sur le cancer ?
Vous souhaitez faire figurer votre plateforme dans cet annuaire ?
➡️ Nous vous remercions de renseigner le formulaire dédié.

Si vous souhaitez modifier les informations d’une plateforme figurant déjà dans l’annuaire ou pour toute question, contactez-nous à l’adresse communication@canceropole-idf.fr. 

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Showing Plateformes 1-10 of 71
Certification : aucune
Type d’analyses : – Etalement de chromosomes métaphasiques – Caryotype (Multi-FISH) – Détection des réarrangements chromosomiques et des aberrations télomériques (Telo/Centro-FISH) – Echanges entre chromatides soeurs (SCE) – Recombinaison télomériques entre chromatides soeurs (CO-FISH) – Immunomarquage combiné au FISH – Détection automatisée de métaphases – Détection automatisée des chromosomes dicentriques – Microscopie automatisée de métaphases à haut débit (jusqu’à 80 lames) pour l’acquisition en lumière transmise ou en fluorescence.
Certification : ISO9001
Type d’analyses : • Culture cellulaire et tests cellulaires fonctionnels sous composition gazeuse contrôlée (dans un environnement Bsl2+) : 4 hottes à flux laminaire, centrifugeuses, microscopes, un compteur cellulaire (Countess, Invitrogen), un lyseur tissulaire (gentleMACS), l’imagerie de cellules vivantes (Incucyte), l’étude du métabolisme cellulaire (SeaHorse) • Phénotypage et tri cellulaire (dans un environnement Bsl2+) : ID7000 Spectral Cell Analyzer (Sony), cytométrie en flux et en images ImageStream MARKII (Cytek Biosciences), FACSymphony Cell Sorter S6 (BD Biosciences), l’isolement de cellules uniques par imagerie (cellenONE), MultiMACS, MicDrop • Multiplexage et quantification des protéines ultrasensibles (immunoanalyses) : Bioplex 200 (Biorad), Intelliflex (Luminex), DropArray (Curiox), Simoa HD-X (Quanterix), Meso QuickPlex SQ 120MM (MSD), Pipelines Olink • Profilage ARN/ADN “bulk” : Nanostring, QIAcuity One 5-plex Device (Qiagen), Bioanalyseur & Tapestation 4150 (Agilent) et Qubit (Invitrogen). • Multi-OMICS à cellule unique : 10X Genomics pipelines (RNAseq, répertoire TCR/BCR, ATACseq, CITEseq), BD Rhapsody (RNAseq, ATACseq), Parse Bioscience pipelines (RNAseq, répertoire TCR/BCR), Singleron (RNAseq+DNAseq), MARSseq, NMTseq • Transcriptomique spatiale : 10X Genomics (Visium, Xenium), Vizgen (Merscope Ultra TM) • Analyse des données (scRNAseq et spatiale, cytométrie en flux multidimensionnelle) : Schnapps, FlowSOM et Qlucore. • Immunomonitoring de précision
Certification : aucune
Type d’analyses : Cytométrie : Autonomisation et accès aux trieurs/analyseurs; Accompagnement dans la conception des expériences Conseil et aide à l’analyse, FlowJO, Recherche de clustering Génomique : Design expérimental : Recommandations sur la préparation des échantillons; Contrôle; Accompagnement dans la sélection de la technologie la mieux adaptée à chaque projet Experiment : Traitement des échantillons par notre équipe; Ou formation de l’utilisateur Analyse de données : Application d’une solution d’analyse standard ou spécifique Microscopie : Autonomisation et accès aux microscopes; Accompagnement dans la conception des expériences Conseil et aide à l’analyse; Mise à disposition de poste d’analyse et de logiciels dédiées BioData Center : Formation : Environnement Linux (ligne de commande, shell); Langage de scripts (R, Python, Bash) Modélisation mathématique; Démultiplexages, Alignements, Variants, SNP, Clustering; Conseil et aide dans le développement d’outils Stockage temporaire des données produits par les autres Pôles
Certification : IBiSA
Type d’analyses : Identification de protéines sur gel ou en solution Caractérisation de modifications post-traductionnelles (PTMs) Caractérisation de protéines recombinantes (Coverage, PTMs, process & product-related impurities, size or charge variants) Recherche de partenaires (Pull-Down) Recherche de biomarqueurs Analyse quantitative des variations d’abondance de protéomes (Label-Free) Analyse de protéomes spécifiques après enrichissement (ex : phosphoprotéome) Analyse de complexes par MS en conditions natives
Certification : IBiSA
Type d’analyses : – Necropsy & gross examination of animal tissues – Design of the protocol – Methodology advice on proper tissue collection – Choice of morphological approaches (fixation, embedding, slide preparation, slide treatments) – Evaluation of the slides – Histological and morphometric analyze – Fine tuning of Histopathology protocols – Discussion of the results – Recommendations for further experiments – Spatial Biology (RNAScope, MACSima) – Digital pathology
Certification : aucune
Type d’analyses : Études d’échantillons fixés ​​​​​-Études multiparamétriques sur cellules, levures, bactéries ou tissus, en imagerie multicolore grâce à un laser blanc offrant une grande flexibilité spectrale -Acquisition d’images en mosaïque et reconstruction. -Mesure de colocalisation et reconstruction 3D des structures observées.​ Études dynamiques sur le vivant ​-Imagerie spatio-temporelle jusqu’à sept couleurs (5D), de l’échelle subcellulaire à tissulaire. -Mesure de la vitesse de diffusion moléculaire à l’aide de techniques telles que la FRAP, la photoactivation et la photoconversion. -Étude cinétique des protéines de réparation après micro-dommages à l’ADN. -Modules de pilotage automatique disponibles pour l’acquisition et l’analyse en mode —-screening de plaques multi-puits, jusqu’à 384 puits, permettant des études à haut débit.​ »
Certification : aucune
Type d’analyses : Profilage non-biaisé d’échantillons biologiques par UHPLC/q-Exactive. Analyse semi-quantitative de larges gammes de molécules endogènes. Élucidation structurale par MS Haute Résolution. Recherche de produits de métabolisation de médicaments par MS Haute Résolution. Analyse quantitative de métabolites candidats. Assister les scientifiques tout au long du projet métabolomique, incluant les étapes pré- et post-analytiques. Aider à définir les questions découlant du projet et le design expérimental y répondant. Mise en place de protocoles d’extraction adaptés à la nature des échantillons. Intégration des données métabolomiques pour l’analyse statistique. Aide à l’interprétation biologique, dans le contexte expérimental.