Lors de l’annonce de la mise en travaux d’un 3e Plan Cancer, le Président de la République a souligné l’aspect prioritaire donné à la bio-informatique notamment dans une vision omics et haut débit, et à la formation sur ces thématiques. Au Cancéropôle Île-de-France, nous avions anticipé cette prise de conscience et avons mis en place dès 2011 des actions permettant aux chercheurs de s’approprier ces nouvelles méthodologies.

Il est indispensable d’avoir, dans les équipes de recherche, des personnes capables de faire le pont entre l’informatique et la biologie, et nous nous sommes pour cela donné pour mission de former des biologistes et des médecins, destinés à œuvrer dans des laboratoires de recherche, en bio-informatique. Les formations leur apporteront le bagage nécessaire pour dialoguer de manière plus efficace avec les bioinformaticiens en charge des analyses, et d’effectuer eux-mêmes des analyses simples des données fournies par les plateformes de séquençage.

Ce mini-site web s’adresse aux chercheurs biologistes travaillant en Île-de-France dans le domaine du cancer et souhaitant s’initier aux techniques NGS.

Retrouvez sur cet espace des ressources, tutoriels, et liens qui pourront vous être utiles,
ainsi que le détail des offres de formations pratiques gratuites
proposées par le Cancéropôle Île-de-France.

Les formations proposées sont de deux types :

• un cycle de formation via des tutoriels vidéos, en libre accès, pour s’initier aux analyses de données DNAseq, RNAseq et épigénomiques avec le logiciel Galaxy, ou encore apprivoiser les logiciels de visualisation ou certaines bases de données publiques.
• pour les chercheurs souhaitant aller plus loin, il sera possible de s’inscrire à une formation de type MOOC couplée à une session d’approfondissement en présentiel permettra d’une part d’acquérir les bases théorique et souhaitant s’initier à l’analyse de données NGS avec R et R Studio.