Technologies & Synergies

Groupe de travail du Cancéropôle IDF

Annuaire des plateformes technologiques d'IDF

Le Cancéropôle Île-de-France a organisé un recensement des plateformes technologiques franciliennes œuvrant dans le domaine de la recherche sur le cancer. Les plateformes identifiées ont été regroupées au sein d’un annuaire mis à disposition de la communauté francilienne.

Vous êtes responsable d’une plateforme technologique francilienne et êtes impliqué dans la recherche sur le cancer ? Vous souhaitez figurer dans cet annuaire ?

Nous vous remercions de renseigner le formulaire dédié.

Pour toute question, n’hésitez pas à nous contacter à l’adresse communication@canceropole-idf.fr.

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Showing Plateformes 31-40 of 43

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 – Métabolomique, Spectrométrie de masse
Certification : aucune
Type d’analyses : Profilage non-biaisé d’échantillons biologiques par UHPLC/q-Exactive. Analyse semi-quantitative de larges gammes de molécules endogènes. Élucidation structurale par MS Haute Résolution. Recherche de produits de métabolisation de médicaments par MS Haute Résolution. Analyse quantitative de métabolites candidats. Assister les scientifiques tout au long du projet métabolomique, incluant les étapes pré- et post-analytiques. Aider à définir les questions découlant du projet et le design expérimental y répondant. Mise en place de protocoles d’extraction adaptés à la nature des échantillons. Intégration des données métabolomiques pour l’analyse statistique. Aide à l’interprétation biologique, dans le contexte expérimental.

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 – Immuno-Oncologie
Certification : aucune
Type d’analyses : Caractérisation phénotypique de différentes populations immunitaires dans le sang, les PBMC et les tissus tumoraux Caractérisation fonctionnelle de différentes populations immunitaires Quantification multiplexe de facteurs solubles dans le plasma, sérum et surnageants de culture Analyses des données de cytométrie en flux Interprétation à façon des données expérimentales selon les demandes des collaborateurs académiques ou industriels Développement de nouveaux panels de cytométrie (jusqu’à 13 couleurs) et de tests fonctionnels en collaboration avec les porteurs de projet Conseil en immunologie antitumorale Conseil en développement de projets de recherche portant sur l’immunothérapie anti-tumorale

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 – Immuno/microenvironnement tumoral
Certification : aucune
Type d’analyses : Cytométrie & Imagerie de masse : Cytométrie en flux, spectrale, et de masse Tri cellulaire et isolement de cellules uniques. Imagerie de masse pour la cartographie spatiale moléculaire, cellulaire et fonctionnelle des cellules et des tissus Bio-informatique adaptée à l’analyse non supervisée des données de cytométrie et d’imagerie. Microscopie : Imagerie confocale et multiphotonique des cellules et tissus Techniques de microscopie photoniques TIRF, live-SR, FRAP, FRET, Photoconversion, pour l’étude des interactions dynamiques à haute résolution Imagerie dynamique multidimensionnelle dans les organes vivants & modèles organoïdes 3D Support au développement de nouveaux dispositifs optiques, nouvelles sondes fluorescentes Imagerie des modèles murins PDX* in vivo Imagerie des modèles organoïdes Imagerie de transfert clinique Le développement des méthodes novatrices intégrant l’imagerie photonique pour la mise au point de nouveaux protocoles, potentiels futurs standards à Gustave Roussy. Le développement de nouvelles méthodologies pour améliorer les étapes clés de la prise en charge des patients en chirurgie et pathologie, telles que l’identification de tissus ou organes (contrôle des marges de résection, diagnostic sur biopsie, préservation des glandes parathyroïdes…) et l’information fonctionnelle (viabilité des lambeaux, drainage lymphatique…). Le transfert d’approches applicables en routine clinique à court terme ou sur la validation clinique de prototypes fournis par des laboratoires académiques ou des industriels.

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 – bioinformatique
Certification : aucune
Type d’analyses : Analyse de données de séquençage en (épi)génomique/transcriptomique (WGS/WES/TGS, RNA-seq, ChIP/ATAC-seq, Single-Cell, Long Reads) Gestion des données (récupération, centralisation, organisation, étiquetage, mise à disposition/partage) Support aux bioinformaticiens, biologistes, et cliniciens de Gustave Roussy Aide à la publication (matériel et méthodes, figures, dépôt des données sur les bases de données publiques comme GEO/SRA/EGA/dbGAP) Co-supervision de bioinformaticiens juniors (stagiaires, CDD, doctorants) Diffusion des savoirs et des compétences pour tous publics (formations internes, formations nationales, cours ouverts en ligne)

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 – Génomique, Transcriptomique, Epigénétique, NGS
Certification : aucune
Type d’analyses : La plateforme de génomique propose : une définition du design expérimental et une aide à l’optimisation des projets des conseils pour la structuration et la mise en place des projets un accompagnement pour la préparation des échantillons et contrôle qualité une mise à disposition de Nanodrop, Bioanalyseur, appareil de PCR quantitative, Covaris S220 du séquençage à haut débit (NovaSeq6000 & MiSeq Illumina) (RNA-seq, ChIP-seq, ATAC-seq, Cut&Tag, …) du single-cell RNA-Seq : en utilisant des cellules : 3’ scRNA-Seq, 5’ scRNA-Seq + TCR +/- BCR, 5’ scRNA-Seq + TCR + CITE-seq ou en utilisant des noyaux : 3’ scRNA-Seq, scATACseq, 3’ scRNAseq + scATACseq

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 – Immuno/microenvironnement tumoral
Certification : ISO9001
Type d’analyses : Mise en œuvre technique de l’histologie de routine : cela comprend l’imprégnation, l’inclusion, la coupe, la coloration, l’immunohistochimie et l’acquisition de lames virtuelles. Développement et mise au point des protocoles d’immunomarquage : utilisation de notre automate LEICA à fond clair ou à fluorescence. Formation théorique et pratique : sur différents postes de travail disponibles à la réservation et sur les techniques d’histologie de base. Conseils et suivi pour les utilisateurs. Participation à l’interprétation et à l’analyse des diapositives.

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 – Génomique, Transcriptomique, Epigénétique, NGS, Génotypage
Certification : aucune
Type d’analyses : Séquençage génome Séquençage exome Séquençage cellule unique Séquençage ARN et épigénétique Génotypage